More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1243 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  51.2 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  42.5 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  43.75 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  45.6 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  41.94 
 
 		 154 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  41.94 
 
 		 154 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  40.38 
 
 		 153 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  40.38 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  52.88 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  41.14 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  37.74 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  38.85 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  40.13 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  39.1 
 
 		 160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  39.74 
 
 		 160 aa  111  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  49.04 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  45.26 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  36.54 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  49.51 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 173 aa  107  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  43.28 
 
 		 152 aa  107  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  45.3 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.31 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  38.46 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  42.97 
 
 		 152 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  40.16 
 
 		 163 aa  104  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  51.82 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  52 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  35.53 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  36.54 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  32.9 
 
 		 158 aa  101  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  38.82 
 
 		 152 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  37.58 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  35.03 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  34.39 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  40.16 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  47.17 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  36.49 
 
 		 144 aa  98.6  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  48.08 
 
 		 157 aa  98.2  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  38.06 
 
 		 150 aa  98.2  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  45.37 
 
 		 152 aa  98.2  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  35.67 
 
 		 152 aa  97.4  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  35.67 
 
 		 152 aa  97.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  35.67 
 
 		 152 aa  97.4  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  48.25 
 
 		 170 aa  97.4  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  35.67 
 
 		 152 aa  97.4  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  45.37 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  45.37 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  38.16 
 
 		 153 aa  97.1  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  47.12 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  46.15 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  38.1 
 
 		 146 aa  96.3  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  46.15 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  45.08 
 
 		 157 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  47.12 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  46.15 
 
 		 157 aa  95.9  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  46.15 
 
 		 157 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  46.97 
 
 		 158 aa  95.9  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  40.67 
 
 		 148 aa  95.9  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  46.15 
 
 		 157 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  46.53 
 
 		 160 aa  95.5  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  41.98 
 
 		 150 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  45.19 
 
 		 157 aa  95.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  46.15 
 
 		 157 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  39.19 
 
 		 157 aa  94.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  41.18 
 
 		 161 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  39.84 
 
 		 143 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  37.93 
 
 		 158 aa  94  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  47 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  42.96 
 
 		 167 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  45.19 
 
 		 157 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  36.6 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  37.41 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  34.09 
 
 		 158 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  38.51 
 
 		 153 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  39.47 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  44.55 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  40.94 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  37.04 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  32.43 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  34.53 
 
 		 154 aa  91.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  39.06 
 
 		 165 aa  91.7  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  37.01 
 
 		 176 aa  91.7  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  32.43 
 
 		 156 aa  91.3  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  32.43 
 
 		 156 aa  91.3  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  37.72 
 
 		 143 aa  91.3  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.54 
 
 		 196 aa  90.9  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  38.64 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  35.2 
 
 		 151 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  46.79 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  40.4 
 
 		 162 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  44.25 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  34 
 
 		 152 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  41.73 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  47.06 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>