More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0387 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  56.74 
 
 
152 aa  163  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  56.34 
 
 
154 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  54.61 
 
 
152 aa  158  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  53.96 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  53.96 
 
 
152 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  51.49 
 
 
152 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  47.26 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  111  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 
160 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  47.86 
 
 
155 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  43.75 
 
 
150 aa  98.2  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  52.78 
 
 
159 aa  97.4  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  45.53 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  44.12 
 
 
166 aa  94.4  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  41.61 
 
 
153 aa  94  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  41.48 
 
 
164 aa  94  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  47.71 
 
 
150 aa  94  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  41.22 
 
 
157 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  40.71 
 
 
154 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  40.71 
 
 
154 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  49.04 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  44.09 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  45.54 
 
 
161 aa  91.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.39 
 
 
157 aa  90.9  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  38.06 
 
 
157 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  39.39 
 
 
157 aa  90.9  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  38.06 
 
 
157 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.64 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  46.79 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17521  ATPase or kinase  39.73 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  37.04 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  49.06 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  39.39 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  38.64 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  51.38 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.39 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  41.38 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  40.69 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  40.69 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  37.88 
 
 
157 aa  89  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  39.19 
 
 
173 aa  89  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  43.18 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  42.75 
 
 
167 aa  88.2  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.16 
 
 
159 aa  87.8  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  40.85 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  35.94 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  40.88 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  36.22 
 
 
145 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  33.57 
 
 
157 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  43.7 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  86.7  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  42.02 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  39.52 
 
 
145 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  55.84 
 
 
158 aa  84.7  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  45.11 
 
 
162 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  45.1 
 
 
158 aa  84.3  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  50.57 
 
 
163 aa  84.3  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  37.78 
 
 
142 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  46.55 
 
 
161 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  35.16 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  42.65 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  41.74 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  45.28 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  48.31 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  41.74 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  44.44 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  41.74 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  41.74 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  39.33 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  41.74 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  46.39 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  43.14 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  42.61 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  41.74 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.74 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  38.51 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  38.51 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  43.24 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  43.14 
 
 
163 aa  82  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  36.36 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  39.04 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  43.55 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  35.94 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  35.94 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  37.84 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  40.87 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  40.87 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  40.82 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  37.8 
 
 
134 aa  80.5  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  40.87 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  44.27 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  40.87 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  40.15 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  51.76 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  42.34 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  37.23 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  39.47 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>