More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1295 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  100 
 
 
158 aa  322  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  46.9 
 
 
152 aa  136  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  41.3 
 
 
157 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.3 
 
 
157 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  41.3 
 
 
157 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.3 
 
 
157 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  46.38 
 
 
169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  41.3 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  41.3 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.86 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  40.58 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  41.83 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  42.31 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  39.86 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  39.13 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  39.44 
 
 
164 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  39.44 
 
 
164 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  39.86 
 
 
158 aa  110  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  39.74 
 
 
173 aa  110  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  39.44 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  38.89 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  39.86 
 
 
153 aa  107  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  39.39 
 
 
152 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  36.77 
 
 
160 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  36.94 
 
 
161 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  43.33 
 
 
143 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  38.41 
 
 
152 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  37.12 
 
 
154 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  37.12 
 
 
154 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  47.15 
 
 
147 aa  105  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  35.26 
 
 
158 aa  104  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  37.75 
 
 
158 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  41.13 
 
 
150 aa  104  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  39.35 
 
 
164 aa  103  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
163 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  38.26 
 
 
156 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  39.73 
 
 
161 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  40.82 
 
 
148 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  38.61 
 
 
160 aa  101  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  43.65 
 
 
152 aa  100  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  34.42 
 
 
161 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  43.12 
 
 
131 aa  100  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  51.49 
 
 
168 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  38.19 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  37.5 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  36.13 
 
 
187 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  38.41 
 
 
154 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  35.67 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  35.67 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  39.16 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  38.89 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  35.85 
 
 
153 aa  97.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  36.42 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  38.64 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  39.52 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  39.52 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  36.42 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  38.64 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  39.19 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  35.22 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  42.28 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  42.34 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  35.03 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  35.86 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  36.08 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  36.42 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  37.16 
 
 
143 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  33.56 
 
 
165 aa  94.4  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  40.18 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  39.23 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  41.01 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  46.46 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  36.3 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  36.2 
 
 
176 aa  91.7  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  38.78 
 
 
181 aa  91.3  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  44.68 
 
 
146 aa  91.3  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  37.4 
 
 
163 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  34.19 
 
 
189 aa  91.3  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  41.6 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  32.03 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  37.09 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  34.19 
 
 
176 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  35.86 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  40.43 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  33.57 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  41.96 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  34.18 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  39.29 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  38.41 
 
 
170 aa  88.2  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  39.34 
 
 
166 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  31.37 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  31.37 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  30.72 
 
 
152 aa  87.8  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  35 
 
 
157 aa  87.4  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  39.13 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  41.07 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  32.45 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>