More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4459 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 146 aa  279  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  63.77 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  56.94 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  61.44 
 
 		 169 aa  150  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  62.68 
 
 		 178 aa  148  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  63.77 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  58.39 
 
 		 170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  59.18 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  55.63 
 
 		 179 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  65.04 
 
 		 176 aa  140  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  58.09 
 
 		 165 aa  140  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  62.24 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  64.75 
 
 		 196 aa  136  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  56.49 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  55.17 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  62.99 
 
 		 184 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  59.2 
 
 		 211 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  57.75 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  66.95 
 
 		 163 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  56.1 
 
 		 195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  60 
 
 		 170 aa  123  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  62.83 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  49.67 
 
 		 181 aa  120  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  58.93 
 
 		 207 aa  117  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  64.67 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  55.4 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  58.55 
 
 		 205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  58.27 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  42.54 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  58.02 
 
 		 182 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  61.65 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  58.78 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  37.14 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.53 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  37.14 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  39.88 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  39.86 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  41.61 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  41.61 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  43.09 
 
 		 184 aa  101  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  41.61 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.61 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  38.62 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  49.28 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  40.43 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  41.84 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  41.13 
 
 		 163 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  40.88 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  37.93 
 
 		 188 aa  97.4  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  41.48 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.15 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  40.15 
 
 		 157 aa  96.7  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  40.15 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.15 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  38.89 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  41.35 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  51.03 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  39.16 
 
 		 171 aa  95.5  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  39.39 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  41.35 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  52.52 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  52.52 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  52.52 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  37.41 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  40.88 
 
 		 163 aa  93.6  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  41.41 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.46 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  38.62 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  35.82 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  42.31 
 
 		 166 aa  90.5  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  43.06 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  40.48 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  39.01 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  46.02 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  37.32 
 
 		 161 aa  87.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  37.59 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  31.97 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.29 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  31.15 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  31.15 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  36.84 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  40.32 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  37.96 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  38.41 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  41.13 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  42.57 
 
 		 172 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  40.94 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  36.67 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  46.39 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  29.08 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  35.11 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  36.49 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  39.52 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  30.95 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  41.18 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  31.93 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  36.5 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  34.19 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>