More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6009 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  302  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  66.43 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  59.42 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  59.03 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  60.58 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  53.02 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  52.32 
 
 		 176 aa  131  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  53.62 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  53.96 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  58.11 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  61.31 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  58.87 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  49.66 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  61.29 
 
 		 196 aa  122  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  55.22 
 
 		 207 aa  121  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  62.99 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  55.4 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  54.47 
 
 		 195 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  54.47 
 
 		 211 aa  117  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  52.53 
 
 		 173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  54.62 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  53.42 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  47.27 
 
 		 181 aa  113  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  58.16 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  41.76 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  56.69 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  42.25 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  50.96 
 
 		 205 aa  103  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  44.53 
 
 		 173 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  43.07 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  45.21 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  54.2 
 
 		 182 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  42.96 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  38.37 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  53.72 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  57.33 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  38.78 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  46.9 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  38.46 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  44.07 
 
 		 184 aa  94.4  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  45.07 
 
 		 153 aa  94.4  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  44.37 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  43.7 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.67 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  40.74 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  41.67 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  40.74 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  41.48 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  40.43 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  40.43 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  40.15 
 
 		 157 aa  90.9  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  41.54 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  42.31 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.54 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  37.72 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  48.82 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.54 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  41.54 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  38.52 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.86 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  40.77 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  39.72 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  56.92 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  42.96 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.3 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  44.09 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  41.73 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  35.96 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  36.92 
 
 		 169 aa  87  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  45.38 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  43.56 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  40.18 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  35.46 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  42.72 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  46.02 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  35.07 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  38.6 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  62.5 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  62.5 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  62.5 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  38.6 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  36.61 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  39.23 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  41.01 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  38.41 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  46.85 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  33.09 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  33.09 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  36.96 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  45.45 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  44.06 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  56.96 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.31 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  37.76 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  44.33 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  42.42 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  46.88 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  32.06 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  32.06 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  36.11 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>