More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0674 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
173 aa  329  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  68.07 
 
 
184 aa  207  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  59.66 
 
 
181 aa  192  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  65.64 
 
 
160 aa  186  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  59.43 
 
 
196 aa  186  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  57.74 
 
 
176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  53.22 
 
 
179 aa  155  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  54.78 
 
 
153 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  55.56 
 
 
170 aa  147  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  55.28 
 
 
163 aa  145  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  50.79 
 
 
207 aa  144  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  49.72 
 
 
211 aa  144  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  48.07 
 
 
195 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  60 
 
 
148 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  53.74 
 
 
165 aa  134  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  54.19 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  50.7 
 
 
170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  60.69 
 
 
182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  59.85 
 
 
157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  53.79 
 
 
157 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  55.84 
 
 
170 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  52.53 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  42.47 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  63.93 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  55.21 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  50.97 
 
 
158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  40.35 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  54.25 
 
 
205 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  50.31 
 
 
169 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  52.21 
 
 
154 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  45.16 
 
 
164 aa  98.6  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  63.85 
 
 
148 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.99 
 
 
160 aa  93.2  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  47.1 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  34.18 
 
 
150 aa  92  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  38.89 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  38.73 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  42.06 
 
 
184 aa  89  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  30.77 
 
 
154 aa  88.2  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  30.77 
 
 
154 aa  88.2  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  40.62 
 
 
152 aa  88.2  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  56.49 
 
 
164 aa  88.2  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  39.06 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  39.06 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  39.06 
 
 
157 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.06 
 
 
157 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  37.88 
 
 
167 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  38.28 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  37.69 
 
 
164 aa  84.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  37.69 
 
 
164 aa  84.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  42.11 
 
 
152 aa  84  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  39.84 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  46.15 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.06 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  37.98 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  41.91 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  36.02 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  39.42 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.98 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  37.98 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  35.44 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  52.23 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  43.2 
 
 
159 aa  82  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  39.06 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  36.13 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.72 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  41.94 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  36.8 
 
 
149 aa  80.5  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  35.29 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  41.67 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.15 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  39.52 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  36.99 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  42.06 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  36.92 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  36.84 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  39.42 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  38.46 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  39.82 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  36.52 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  48.96 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  36.52 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  36.36 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  44.95 
 
 
149 aa  77.4  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  39.57 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  32.79 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  36.29 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  36.36 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  37.18 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  36.36 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  51.72 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  41.13 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  42.06 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  36.64 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  35.93 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  35.25 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  35.25 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  40.52 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  35.33 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>