More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0809 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  289  7e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  50.41 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  40.82 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  44.26 
 
 
160 aa  93.2  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  34.03 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  34.35 
 
 
146 aa  90.1  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  34.88 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  39.73 
 
 
509 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  35.66 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  29.71 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  34.51 
 
 
158 aa  87  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  34.59 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  35.92 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  32.58 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  42.97 
 
 
176 aa  83.6  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  34.06 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.29 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  41.41 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  33.85 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  33.83 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  40.14 
 
 
504 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.09 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  34.85 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  32.87 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  38.39 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  43.09 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  36.23 
 
 
170 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  35.35 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  37.98 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  34.65 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.08 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  33.83 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  36.92 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  28.68 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  28.68 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  32.87 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  37.37 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  33.08 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  34.59 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  34.59 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  39.2 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  34.59 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  34.04 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  34.59 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  34.04 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  34.59 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  34.59 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  34.59 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.08 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  33.08 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  34.59 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  34.59 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  39.06 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  43.81 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  34.59 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  34.59 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  32.58 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  34.59 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  34.59 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  34.59 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  34.59 
 
 
153 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  36.69 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  36.59 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  34.68 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  42.62 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  36.3 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  35.04 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  30.47 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  38 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  31.54 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  41.12 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  36.07 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  34.11 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  31.91 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  35.56 
 
 
188 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  30.16 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  34.88 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  34.21 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  29.79 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  35.04 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  36.72 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  27.27 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  27.27 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  37.74 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  37.01 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  37.01 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  33.87 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  32.48 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  36.73 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  35.96 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  41.94 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  32.59 
 
 
157 aa  72  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>