More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4283 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  54.1 
 
 
154 aa  142  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  48.85 
 
 
143 aa  141  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  50.38 
 
 
135 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  51.61 
 
 
140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  51.59 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  43.28 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  41.04 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  44.44 
 
 
134 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  39.53 
 
 
160 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  43.08 
 
 
140 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  36.69 
 
 
154 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  36.69 
 
 
154 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  40.52 
 
 
153 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0073  protein of unknown function UPF0079  40.94 
 
 
156 aa  100  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 
157 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  37.96 
 
 
157 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.96 
 
 
157 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  41.8 
 
 
157 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  46.24 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  40.98 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  44.68 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  35.61 
 
 
161 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  39.64 
 
 
187 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.96 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  38.21 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.61 
 
 
161 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  33.83 
 
 
153 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  40.16 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  40.16 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  40.16 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  40.32 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.16 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  39.02 
 
 
164 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  41.51 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  41.51 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  38.18 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  33.08 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  33.08 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  44.66 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  37.61 
 
 
173 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  36.52 
 
 
152 aa  94.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  36.36 
 
 
158 aa  93.6  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  37.01 
 
 
155 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3215  protein of unknown function UPF0079  36.76 
 
 
194 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  39.13 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  30.88 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  37.19 
 
 
155 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  38.6 
 
 
183 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  44.21 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  39.39 
 
 
152 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  39.81 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  39.09 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  34.81 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0596  hypothetical protein  40.35 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  35.56 
 
 
152 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  35.56 
 
 
152 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  35.56 
 
 
152 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  38.02 
 
 
159 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  35.56 
 
 
152 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  39.26 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  38.28 
 
 
153 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  33.91 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  33.91 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  33.91 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0723  hypothetical protein  38.46 
 
 
184 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  39 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  35.07 
 
 
152 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  36.79 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0936  hypothetical protein  45.54 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000264552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1306  hypothetical protein  39.39 
 
 
181 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134603  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  35.34 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  32.84 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  48.51 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0747  hypothetical protein  32.88 
 
 
192 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  39 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  35.34 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  40.66 
 
 
162 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  35.34 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  39.22 
 
 
127 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  39.8 
 
 
160 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  35.88 
 
 
155 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  31.9 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0366  hypothetical protein  41.12 
 
 
184 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1065  hypothetical protein  41.12 
 
 
184 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  31.9 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2501  hypothetical protein  41.12 
 
 
184 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  31.9 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  35.19 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0666  hypothetical protein  41.12 
 
 
184 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.739663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  41.12 
 
 
184 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  41.41 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0911  hypothetical protein  41.12 
 
 
184 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  35.2 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  31.9 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>