More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0927 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  285  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  43.28 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  45.04 
 
 
140 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  46.56 
 
 
135 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  42.96 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  43.94 
 
 
140 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  37.68 
 
 
159 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  40.32 
 
 
150 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  42.73 
 
 
154 aa  100  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  37.82 
 
 
187 aa  96.7  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  37.01 
 
 
189 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  44.04 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  36.43 
 
 
134 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  33.83 
 
 
158 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  40.31 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  36.13 
 
 
176 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  37.12 
 
 
153 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  35.29 
 
 
157 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  37.9 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  34.29 
 
 
160 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  31.62 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  31.39 
 
 
174 aa  88.2  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  39.42 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  35.07 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  35.29 
 
 
157 aa  85.9  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.07 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.29 
 
 
157 aa  85.9  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  38.58 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  34.56 
 
 
157 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  34.56 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  34.56 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  34.56 
 
 
157 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  37.37 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  31.4 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  36.89 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  33.83 
 
 
173 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  33.86 
 
 
153 aa  84  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  34.58 
 
 
153 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  34.58 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  39 
 
 
160 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  34.58 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  33.86 
 
 
161 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  34.58 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  37.4 
 
 
161 aa  84  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  34.58 
 
 
153 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  35.96 
 
 
141 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  34.56 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  34.58 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  34.58 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  34.58 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  34.58 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  34.58 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  36.99 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  36.89 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  39.64 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  34.58 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  34.58 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  31.78 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  36.52 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  34.58 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  34.58 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  37.37 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  32.59 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  39.13 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  37.37 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  37.37 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  37.37 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  37.37 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  30.83 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  37.59 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  34.07 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  38.04 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  37.9 
 
 
152 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  38.46 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  31.85 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  31.3 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  35.9 
 
 
184 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  42.45 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  37.04 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  35.45 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  32.73 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  35.24 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  32.73 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  35.25 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  32.73 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  33.06 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  34.09 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  31.62 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  29.55 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  35 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1664  ATPase or kinase  35.04 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  33.65 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>