More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0182 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
148 aa  295  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  45.11 
 
 
150 aa  111  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  48.31 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  41.54 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  41.54 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  41.04 
 
 
152 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  42.61 
 
 
161 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  41.41 
 
 
159 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  38.06 
 
 
155 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  40.3 
 
 
157 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  34.69 
 
 
162 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  39.55 
 
 
157 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  39.55 
 
 
157 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  39.55 
 
 
157 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.55 
 
 
157 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  42.19 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  42.42 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  39.13 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  39.13 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  40.88 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  35.48 
 
 
153 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  38.81 
 
 
157 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.81 
 
 
157 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  38.81 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.81 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  39.06 
 
 
157 aa  97.1  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  38.06 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  42.42 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1492  hypothetical protein  43.94 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  40.58 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  39.53 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  33.56 
 
 
160 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  38.97 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  36.76 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  37.98 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  36.3 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  40.91 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  38.28 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  39.26 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  38.28 
 
 
161 aa  91.3  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  34.48 
 
 
160 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  34.27 
 
 
163 aa  89.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  34.13 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  34.27 
 
 
174 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  35.29 
 
 
165 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  34.92 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  40.74 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  36.97 
 
 
159 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  32.87 
 
 
163 aa  86.7  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  35.16 
 
 
170 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  34.72 
 
 
161 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  35.34 
 
 
178 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  38.57 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  38.4 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  32.87 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  34.29 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  36.09 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  38.14 
 
 
143 aa  84.3  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  34.87 
 
 
184 aa  84.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  31.65 
 
 
176 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  34.38 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  39.04 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  39.53 
 
 
167 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  32.28 
 
 
158 aa  84  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  36.43 
 
 
171 aa  83.6  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  34.31 
 
 
167 aa  83.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  33.08 
 
 
164 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  33.61 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  33.61 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  35.66 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  36.09 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  34.53 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  36.45 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  33.61 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  36.94 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  32.59 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  36.45 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  34.15 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  33.56 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  38.69 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  37.31 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  35.43 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  30.47 
 
 
165 aa  80.1  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  31.54 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  35.44 
 
 
179 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  40.83 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  32.56 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  36.21 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  39.29 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  34.65 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  35.82 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  38.64 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  37.3 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  37.01 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>