More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2440 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2440  ATPase  100 
 
 		 154 aa  323  5e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  54.1 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  47.75 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  55.66 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  44.72 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  41.73 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  42.73 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  41.53 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  37.31 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  37.7 
 
 		 153 aa  94.4  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  37.21 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  41.74 
 
 		 140 aa  90.5  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  33.86 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  34.53 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  40.74 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  30.37 
 
 		 173 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  36.13 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  35.48 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  34.65 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3198  hypothetical protein  36.22 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.250751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  34.65 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.13 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  33.08 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  31.43 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  35.71 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  31.43 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  31.43 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  34.51 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  36 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  30.77 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  33.86 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  31.21 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  31.21 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  33.07 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  33.07 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  33.07 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.07 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.07 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  33.58 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  39.25 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  35.9 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  32.62 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  36.29 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  32.8 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  33.06 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  40.83 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  40.83 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  41.82 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  34.51 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  38.05 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0073  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  33.07 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  38.33 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  35.48 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  36.89 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  32.58 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  31.78 
 
 		 169 aa  80.1  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  35.65 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  39.29 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  35.65 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  34.4 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  33.09 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  31.01 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  31.82 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  33.85 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  29.63 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  31.65 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  33.9 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  35.29 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  27.74 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  42.54 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  36.28 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  37.17 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  31.21 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  36.21 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  27.86 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  34.38 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  36.36 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  34.45 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  32.37 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  36.21 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  32.33 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  33.56 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  31.93 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  36.97 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  35.56 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  39.39 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  27.34 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  30.08 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  34.75 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  31.93 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  31.93 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  34.68 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  34.48 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>