More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_339 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  326  7e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  93.87 
 
 		 163 aa  310  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  92.64 
 
 		 163 aa  307  5e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  48.37 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  48.37 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  48.37 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  47.71 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  47.71 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  47.71 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  47.71 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  47.06 
 
 		 157 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  47.71 
 
 		 157 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  47.71 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  46.41 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  46.36 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  41.82 
 
 		 173 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  42.94 
 
 		 189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  44.37 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  44 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  43.59 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  44.59 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  40.65 
 
 		 187 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  41.83 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  42.76 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  41.38 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  41.38 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  45.33 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  43.48 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  39.74 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  38.12 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  38.36 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  41.45 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  45.99 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  43.54 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  37.82 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  41.56 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  39.62 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  43.84 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  37.58 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  44.53 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  36.99 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  45.08 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  36.54 
 
 		 184 aa  107  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  46.79 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  40.14 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  44.12 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  39.84 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  36.3 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  42.14 
 
 		 152 aa  104  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  45.69 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  48.74 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  39.58 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  42.76 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  39.44 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  38.89 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  38.89 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  46.88 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  38.85 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  46.88 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  35.1 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  35.14 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  33.79 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  37.33 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  38.46 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  47.06 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  40.56 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  39.85 
 
 		 182 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  40.58 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.23 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  31.88 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  36.23 
 
 		 183 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  34.42 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  34.67 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  36.89 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  34.87 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  40.37 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  34.06 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  38.76 
 
 		 188 aa  90.5  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2026  hypothetical protein  42.62 
 
 		 156 aa  90.5  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  36.08 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  36.08 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  36.71 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  41.26 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  34.36 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  36.08 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  47.17 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  37.41 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  34.64 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  40.4 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  34.64 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  40.29 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  40.6 
 
 		 143 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  37.41 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  33.56 
 
 		 146 aa  87.8  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  35.86 
 
 		 153 aa  87.8  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  42.73 
 
 		 135 aa  87.8  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>