More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2319 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  334  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  59.21 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  59.21 
 
 		 153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  52.67 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  51.28 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  53.95 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  52.32 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  49.34 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  50.99 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  53.38 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  49.66 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  43.67 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  43.67 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  43.67 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  49.66 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  43.67 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  43.67 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  43.04 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  43.04 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  42.5 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  44.59 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  44.3 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  44.59 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  45.21 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  42.76 
 
 		 189 aa  133  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  42.11 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  42.95 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  40.12 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  44.06 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  41.83 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  38.31 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  43.75 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  43.75 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  41.18 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  43.75 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  44.68 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  41.18 
 
 		 163 aa  123  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  45.75 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  44.37 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  36.24 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  42 
 
 		 169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  41.1 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  36.91 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  37.74 
 
 		 184 aa  114  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  48.28 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  42.47 
 
 		 147 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  44.74 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  40.54 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  43.44 
 
 		 188 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  43.44 
 
 		 183 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  41.33 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  40.14 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  40.13 
 
 		 505 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  45.45 
 
 		 143 aa  107  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  40.91 
 
 		 503 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  38.46 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  43.38 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  37.68 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  34.69 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 174 aa  100  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  42.96 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  37.01 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  35.86 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  38.78 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  37.69 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  34.64 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  36.3 
 
 		 145 aa  97.8  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  36.36 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  38.06 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  36.43 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  39.16 
 
 		 513 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  41.91 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  35.06 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.23 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  35 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  36.73 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  37.01 
 
 		 152 aa  94  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  39.16 
 
 		 513 aa  93.6  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  35.76 
 
 		 158 aa  93.6  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  34.42 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  34.42 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  35.71 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  30.88 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  34.42 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  34.42 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  44.36 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  33.55 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  35.34 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  35.34 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  37.32 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  38.78 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>