More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2993 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 140 aa  295  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  55.07 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  51.61 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  48.44 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  45.04 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  55.66 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  47.66 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  42.06 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  48.04 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  36.57 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  36.57 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  43.14 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  43.64 
 
 		 173 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  40.18 
 
 		 187 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  39.37 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  44.57 
 
 		 176 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  39.17 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  41.82 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  35.29 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  39.17 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  35.82 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  44.23 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  43 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  41.75 
 
 		 184 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  36.11 
 
 		 155 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0723  hypothetical protein  40.38 
 
 		 184 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  41.88 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  43.43 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  40.34 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  45 
 
 		 155 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  36.7 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  38.79 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2083  hypothetical protein  36.75 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2004  hypothetical protein  35.9 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  37.72 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  44.19 
 
 		 184 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0366  hypothetical protein  44.19 
 
 		 184 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0908  hypothetical protein  44.19 
 
 		 184 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1065  hypothetical protein  44.19 
 
 		 184 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0666  hypothetical protein  44.19 
 
 		 184 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.739663  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0911  hypothetical protein  44.19 
 
 		 184 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2501  hypothetical protein  44.19 
 
 		 184 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  37.72 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  40.78 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  34.85 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  34.85 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  34.85 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  39.02 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  34.85 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  38.79 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  38.79 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  38.79 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  38.21 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.79 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  42.55 
 
 		 141 aa  83.6  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  37.29 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  38.66 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  37.17 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  39.05 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  37.93 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0747  hypothetical protein  44.19 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.93 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  37.93 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  40 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  36.61 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3215  protein of unknown function UPF0079  44.19 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2586  hypothetical protein  38.83 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  39.05 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  41.28 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  39.05 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  37.96 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  36.97 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  35.16 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  37.93 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0734  hypothetical protein  38.83 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.93 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  36.51 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  39.45 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  37.7 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1951  hypothetical protein  38.83 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286384  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0266  hypothetical protein  31.47 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.0000898958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2562  hypothetical protein  38.83 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  37.04 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2481  hypothetical protein  39.81 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0482851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5894  hypothetical protein  37.86 
 
 		 184 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2610  hypothetical protein  39.81 
 
 		 198 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  38.26 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  38.39 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  37.25 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  35.96 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  35.83 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>