More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1260 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 140 aa  293  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  43.94 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  43.48 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  43.08 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  39.85 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  40.58 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  41.74 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  38.35 
 
 		 159 aa  89.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  44.23 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  36.51 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  34.59 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  34.59 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  32.58 
 
 		 174 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3198  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.250751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  36.07 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  35.77 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  35.16 
 
 		 160 aa  84  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  35.61 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  35.61 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  35.29 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  35.48 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  35.61 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.61 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  35.61 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  35.88 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  38.26 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  35.61 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.61 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.61 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.43 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  37.86 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  34.51 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  34.51 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  38.18 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  37.93 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.29 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  35.34 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1157  hypothetical protein  36.75 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  38.46 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  38.05 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  38.05 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  35.51 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.19 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.19 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  36.72 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  34.85 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  40.78 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  34.51 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  35.77 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  32.23 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  34.59 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  33.85 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  33.85 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  33.85 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  33.85 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  35.9 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  40.18 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  33.85 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  31.62 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  36.04 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  36.72 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  27.74 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  31.88 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  41.07 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  33.85 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  33.85 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  33.87 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  32.8 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  31.78 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  39.05 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  33.63 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  34.85 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  33.9 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  39.81 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  40 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  31.01 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  41.12 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0596  hypothetical protein  35.51 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0186  hypothetical protein  35.9 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  35.71 
 
 		 163 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  34.55 
 
 		 163 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  38.38 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  34.43 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  33.62 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  36.94 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  38.14 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  31.88 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  36.61 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1261  protein of unknown function UPF0079  35.83 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.810955  normal  0.0782471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  30.65 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  37.37 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1130  hypothetical protein  34.86 
 
 		 160 aa  70.1  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.30959 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  35.65 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  34.19 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>