More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1987 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  296  9e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  61.54 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  56.64 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  54.93 
 
 		 146 aa  156  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  53.19 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  51.06 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  53.19 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  38.24 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  38.13 
 
 		 157 aa  93.6  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  38.71 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  36.17 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.82 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  42.99 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  37.04 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  37.5 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  36.43 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  41.96 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.43 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  34.51 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  32.17 
 
 		 173 aa  86.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  35.71 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  37.69 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  39.06 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.71 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  38.81 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.71 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  36.15 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  42.99 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  34.21 
 
 		 161 aa  84.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  39.09 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  40.91 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  37.84 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  32.59 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  39.09 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  39.64 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  39.09 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  39.09 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  39.09 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  41.73 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1261  protein of unknown function UPF0079  32.41 
 
 		 178 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.810955  normal  0.0782471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  42.73 
 
 		 188 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  41.07 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  34.68 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  34.68 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  42.72 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  35.82 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.3 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  34.09 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  38.03 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  41.67 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.52 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  40.18 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  34.96 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  41.07 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  36.69 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  27.66 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  36.69 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  38.06 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.25 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  35.71 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  39.62 
 
 		 162 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  36.15 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  38.74 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  34.03 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  39.16 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  32.61 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  34.23 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  36.04 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  35.4 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  34.85 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  34.59 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  42.48 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  39.47 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  41.35 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  41.35 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  37.5 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  37.3 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  41.35 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  41.35 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  41.35 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0073  protein of unknown function UPF0079  34.11 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  41.35 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  41.35 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  41.35 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  41.35 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>