More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2666 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  300  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  66.2 
 
 
151 aa  201  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  65.25 
 
 
145 aa  187  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  60.87 
 
 
158 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  59.57 
 
 
146 aa  178  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  58.99 
 
 
146 aa  173  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  54.14 
 
 
145 aa  147  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  40.28 
 
 
154 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  40.28 
 
 
154 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  44.96 
 
 
160 aa  110  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  48.18 
 
 
164 aa  103  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  41.13 
 
 
152 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  39.55 
 
 
159 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  39.45 
 
 
149 aa  94  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  34.03 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  34.06 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  34.03 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  38.58 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  37.72 
 
 
184 aa  91.3  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  37.21 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  36.62 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  32.62 
 
 
187 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  35.77 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  38.41 
 
 
183 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  39.09 
 
 
150 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  32.37 
 
 
189 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.68 
 
 
163 aa  89  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  34.27 
 
 
162 aa  88.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  36.5 
 
 
164 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  41.53 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  38.28 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  38.71 
 
 
183 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  38.71 
 
 
188 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  40.18 
 
 
167 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  33.81 
 
 
174 aa  87  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  34.56 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  32.87 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  38.6 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  34.06 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  37.17 
 
 
173 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  40.37 
 
 
158 aa  84.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  33.86 
 
 
158 aa  84  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  34.06 
 
 
150 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  37.17 
 
 
144 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  38.89 
 
 
158 aa  83.6  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  40.18 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  43.27 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  33.58 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  35.66 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  33.82 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.09 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.09 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.82 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  30.71 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  31.47 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  33.09 
 
 
157 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  31.43 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  34.48 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  40.69 
 
 
540 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  38.46 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  32.37 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  32.37 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  37.96 
 
 
506 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  39.25 
 
 
523 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  41.61 
 
 
549 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  41.61 
 
 
542 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  33.09 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.1 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  30.88 
 
 
157 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  38.05 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  37.19 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  35.09 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  35.82 
 
 
504 aa  77  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  39.42 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  35.51 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  31.94 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  35.25 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  33.09 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  36.5 
 
 
505 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  35.96 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  31.25 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  37.68 
 
 
513 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  37.86 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  37.68 
 
 
513 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  35.77 
 
 
505 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  38.05 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  38.39 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  37.82 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  28.57 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  36.84 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>