More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2508 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  290  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  42.24 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  42.28 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  34.81 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  40.15 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  37.12 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  44.74 
 
 
174 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.94 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 
160 aa  90.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.84 
 
 
157 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  40.62 
 
 
155 aa  90.1  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  33.58 
 
 
157 aa  89.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  35.34 
 
 
153 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.84 
 
 
157 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  38.33 
 
 
156 aa  89  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  36.09 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  36.09 
 
 
157 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  36.09 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  36.51 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.09 
 
 
157 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  38.89 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  39.23 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  36.36 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  36.09 
 
 
157 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  36.09 
 
 
157 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.09 
 
 
157 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  36.84 
 
 
157 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  42.03 
 
 
170 aa  86.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  34.38 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  45.69 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  35.34 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  35.88 
 
 
158 aa  84.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  43.41 
 
 
165 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  35.56 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  47.54 
 
 
207 aa  84.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  37.17 
 
 
143 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  33.58 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  44.26 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  35.66 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  40.68 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  40.87 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.2 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  45.86 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  38.58 
 
 
164 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  33.83 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  35.34 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  37.82 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.68 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  31.58 
 
 
173 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.68 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  43.33 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  34.07 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  35.59 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  37.21 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  33.83 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  40.62 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  39.13 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  39.8 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  35.96 
 
 
145 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  35.48 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  31.78 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  34.62 
 
 
174 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  46.02 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  39.37 
 
 
211 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  33.09 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  35.59 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  31.06 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  30.3 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  34.62 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  37.84 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  36.61 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  32.28 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  32.06 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  35.25 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  35.48 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  33.91 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  31.34 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  41.22 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  33.87 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  32.33 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  34.75 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  41.43 
 
 
183 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  39.84 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  34.68 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  34.68 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.11 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  42.15 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  34.31 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  41.43 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  35.11 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  41.54 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  34.59 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  33.57 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  34.68 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>