More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0100 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 151 aa  316  7.999999999999999e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  65.73 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  66.2 
 
 		 143 aa  201  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  64.58 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  61.7 
 
 		 158 aa  187  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  53.52 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  57.14 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  43.08 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  38.1 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  38.1 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  37.67 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  37.76 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  42.11 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  39.69 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  36.17 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  40.46 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  41.48 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  36.81 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  36.81 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  39.55 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.96 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  40.15 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.68 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  37.68 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  36.96 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.96 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.23 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  39.71 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  36.76 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  98.6  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  35.86 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  36.96 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  35.51 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  39.26 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  35.34 
 
 		 161 aa  97.1  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  34.72 
 
 		 157 aa  97.1  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  38.57 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  36.3 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  34.56 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  36.23 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  37.23 
 
 		 187 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  31.88 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  34.81 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  38.17 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  36.3 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  30.94 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  42.14 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  37.78 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  38.17 
 
 		 188 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  35.2 
 
 		 184 aa  90.9  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  35.04 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  38.17 
 
 		 183 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  31.94 
 
 		 173 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.23 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  34.88 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  36.43 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  41.38 
 
 		 182 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  37.78 
 
 		 161 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  36.18 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  33.8 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  34.92 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  29.5 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  33.58 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  34.72 
 
 		 167 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  31.29 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  35.46 
 
 		 171 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  40.95 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  33.58 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  40.91 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  37.12 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  33.83 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  30.3 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  30.3 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  32.12 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  35.04 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  36.84 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  34.25 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  32.87 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  33.81 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  32.84 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  34.68 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  38.46 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  31.47 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  35.42 
 
 		 497 aa  75.9  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  34.96 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  34.23 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  31.43 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  32.14 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  33.1 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  29.01 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  35.71 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  30.15 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  33.09 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  30.88 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  36.13 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>