More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4044 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
170 aa  325  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  70.37 
 
 
165 aa  195  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  65.33 
 
 
153 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  67.38 
 
 
147 aa  175  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  61.54 
 
 
160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  57.96 
 
 
179 aa  168  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  52.1 
 
 
196 aa  158  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  57.59 
 
 
184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 
176 aa  151  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  60.4 
 
 
163 aa  151  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  60 
 
 
170 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  56.16 
 
 
157 aa  147  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  59.15 
 
 
211 aa  147  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  64.41 
 
 
181 aa  147  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  64.03 
 
 
148 aa  147  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  66.92 
 
 
178 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  61.24 
 
 
205 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  57.14 
 
 
158 aa  134  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  55.56 
 
 
173 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  55.81 
 
 
195 aa  130  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  57.93 
 
 
157 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  60.38 
 
 
182 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  57.66 
 
 
169 aa  124  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  52.52 
 
 
207 aa  120  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  57.25 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  41.76 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  42.11 
 
 
190 aa  115  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  53.62 
 
 
157 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  54.47 
 
 
154 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  62.61 
 
 
146 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.78 
 
 
155 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  37.32 
 
 
160 aa  100  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.24 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  39.16 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  39.16 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  44.53 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  39.86 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  39.16 
 
 
157 aa  98.2  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.16 
 
 
157 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  39.16 
 
 
157 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  57.24 
 
 
159 aa  97.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.16 
 
 
157 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  39.86 
 
 
163 aa  97.1  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  39.71 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  38.46 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.16 
 
 
157 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  40.56 
 
 
163 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  43.22 
 
 
184 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  39.16 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.86 
 
 
152 aa  93.6  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  39.86 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  40.74 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  40.74 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  63.16 
 
 
148 aa  91.7  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  39.86 
 
 
158 aa  91.3  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  37.16 
 
 
167 aa  91.3  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  40.85 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  38.69 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  33.79 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  37.5 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  32.21 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  42.19 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  38.69 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  38.46 
 
 
163 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  57.55 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  39.39 
 
 
141 aa  89  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  41.3 
 
 
160 aa  88.6  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  38.46 
 
 
152 aa  87.8  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  53.23 
 
 
154 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  37.58 
 
 
176 aa  87.4  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 
152 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  35.16 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  42.03 
 
 
144 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  39.58 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  50.67 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  50.67 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  50.67 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  36.3 
 
 
158 aa  85.1  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  38.57 
 
 
147 aa  85.1  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  31.08 
 
 
161 aa  85.1  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  34.75 
 
 
153 aa  84.3  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  34.9 
 
 
165 aa  84  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  40.54 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  34.27 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  38.41 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  34.59 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  39.47 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  47.06 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  40.91 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  40.48 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.27 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  42.73 
 
 
148 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  37.06 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  39.17 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  42.73 
 
 
148 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  34.31 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  36.62 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>