More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2888 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  329  8e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  58.97 
 
 		 159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  58.67 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  51.28 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  52.23 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  52.23 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  54 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  52.23 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  51.59 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  51.59 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  51.59 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  50.96 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  51.59 
 
 		 157 aa  160  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  51.59 
 
 		 157 aa  160  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  52.98 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  51.41 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  50.32 
 
 		 161 aa  153  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  46.1 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  53.38 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  48.41 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  46.75 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  47.3 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  48.05 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  49.34 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  46.75 
 
 		 153 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  43.62 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  43.62 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  46.36 
 
 		 187 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  52.86 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  44.08 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  46.36 
 
 		 189 aa  137  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  46.31 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  43.59 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  48.63 
 
 		 173 aa  133  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  47.22 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  43.9 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.9 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  43.14 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  45.51 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  41.33 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  43.14 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  41.83 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  50.42 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  44.81 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  47.59 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  42.31 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  47.62 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  52.29 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  43.33 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  39.1 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  40.54 
 
 		 183 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  45.71 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  47.1 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  46.38 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  44.93 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  42.48 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  39.74 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  38.26 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  41.04 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  42.03 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  40.13 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.68 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  37.65 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  44.26 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  43.4 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  45.93 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  42.36 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  45.93 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  51.67 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  42.76 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  38.06 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  43.65 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  41.61 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  51.67 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  47.62 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  43.55 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  40.88 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  41.67 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  45.38 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  40.46 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  40.3 
 
 		 504 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  43.28 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  43.38 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  43.38 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  43.38 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  41.04 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  41.48 
 
 		 160 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  37.96 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  37.96 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  44.19 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  42.61 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  42.11 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  42.11 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>