More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2016 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  58.67 
 
 
161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  56 
 
 
159 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  49.34 
 
 
162 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  48.99 
 
 
160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  47.2 
 
 
189 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  50.65 
 
 
173 aa  148  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  52.86 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  47.1 
 
 
187 aa  143  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  51.01 
 
 
161 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  42.86 
 
 
163 aa  140  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  43.51 
 
 
163 aa  138  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  45.89 
 
 
157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  45.89 
 
 
157 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  41.56 
 
 
163 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  46.1 
 
 
153 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  45.89 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  40.67 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  40.67 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  45.21 
 
 
157 aa  133  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  45.21 
 
 
157 aa  133  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  45.21 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  45.21 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  45.21 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  45.21 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  47.65 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  45.21 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  46.98 
 
 
153 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  43.42 
 
 
176 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  45.21 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  47.86 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  43.75 
 
 
152 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  40.97 
 
 
156 aa  130  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  45.86 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  42.57 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  45.64 
 
 
160 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  38.56 
 
 
160 aa  123  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  40.38 
 
 
174 aa  123  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  40.65 
 
 
158 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  45.11 
 
 
149 aa  120  9e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  39.86 
 
 
171 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
150 aa  117  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  41.96 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  37.91 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.82 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  41.67 
 
 
164 aa  110  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  41.98 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  42.38 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  39.47 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  43.61 
 
 
152 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  41.55 
 
 
152 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
150 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  42.57 
 
 
183 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  39.33 
 
 
149 aa  104  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  44.86 
 
 
143 aa  102  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  46.43 
 
 
182 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  41.23 
 
 
143 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  35.53 
 
 
184 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 
151 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  45.08 
 
 
183 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  41.55 
 
 
164 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  45.08 
 
 
188 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  43.2 
 
 
161 aa  100  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  45.83 
 
 
161 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  35.17 
 
 
169 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  45.04 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  34.72 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  45.32 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  41.22 
 
 
504 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  44.68 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
146 aa  97.8  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  46.72 
 
 
152 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34 
 
 
164 aa  97.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34 
 
 
164 aa  97.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.46 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  35.71 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  42.97 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.93 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  42.97 
 
 
152 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  35.86 
 
 
148 aa  94.4  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  39.71 
 
 
505 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  37.01 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 
503 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  37.16 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  41.18 
 
 
178 aa  91.3  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  39.86 
 
 
170 aa  91.3  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  40.44 
 
 
167 aa  90.9  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  33.59 
 
 
158 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  35.26 
 
 
158 aa  90.5  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  33.55 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  39.16 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  41.98 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  38.24 
 
 
154 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  36.49 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  40.62 
 
 
188 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  34.04 
 
 
188 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  33.59 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>