More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0774 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  338  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  46.26 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  44.81 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  44.74 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  39.6 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  39.87 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  43.24 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  41.18 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  41.18 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  41.67 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  41.33 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  40.52 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  40.52 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  41.56 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  40.52 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.52 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.52 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  40.52 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  40.4 
 
 		 189 aa  107  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.52 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  38.36 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  39.87 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  39.86 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  40.82 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  36.49 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  42.62 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  37.75 
 
 		 187 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  37.58 
 
 		 184 aa  100  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  41.8 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  37.93 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  42.15 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  41.1 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  37.01 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  39.58 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  37.33 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  37.76 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  39.52 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  34.67 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  34.46 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  38.81 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  36 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  36.67 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  41.46 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  39.2 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  39.2 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.29 
 
 		 161 aa  92  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  34.9 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  39.71 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  33.78 
 
 		 176 aa  90.9  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  32.67 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  39.1 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  38.69 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  37.01 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  37.01 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  39.06 
 
 		 163 aa  87.8  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  39.29 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  37.59 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  35.48 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  40.52 
 
 		 148 aa  84.7  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  34.16 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  43 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  33.55 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  35.82 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  38.81 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  38.1 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  38.05 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  33.81 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  33.81 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  37.61 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  37.31 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  40.18 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  34.06 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  35.04 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  38.06 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  38.58 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  36.72 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  32.19 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  35.71 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  40.35 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  36.76 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  34.01 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  34.01 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  34.01 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  34.01 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  34.01 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  34.01 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  37.61 
 
 		 540 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  40.95 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  34.01 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  34.01 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  34.01 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  37.61 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  34.72 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  34.07 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  40.38 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>