More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0376 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  288  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  72.92 
 
 
169 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  45.89 
 
 
157 aa  147  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  45.21 
 
 
157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  45.21 
 
 
157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  45.21 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  45.21 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  44.52 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  45.21 
 
 
157 aa  144  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  45.21 
 
 
157 aa  144  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  45.21 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  44.22 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  43.84 
 
 
157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  56.74 
 
 
148 aa  142  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  48.18 
 
 
152 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  43.75 
 
 
152 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  46.38 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  46.9 
 
 
153 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  45.21 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  42.65 
 
 
155 aa  126  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  43.88 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  48.23 
 
 
150 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  40.4 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  43.84 
 
 
163 aa  123  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  38.78 
 
 
153 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 
153 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  40.67 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  42.86 
 
 
163 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  44.52 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  43.79 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  44.06 
 
 
154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  44.06 
 
 
154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  40.82 
 
 
163 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  42.42 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  40.91 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  54.05 
 
 
184 aa  111  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  39.86 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  41.06 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  41.38 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  38.36 
 
 
159 aa  103  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  37.84 
 
 
164 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  37.84 
 
 
164 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  37.67 
 
 
160 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  44.37 
 
 
153 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  41.13 
 
 
152 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  46.22 
 
 
143 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  41.73 
 
 
167 aa  100  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  45.04 
 
 
143 aa  100  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  35.14 
 
 
153 aa  100  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  39.31 
 
 
173 aa  100  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  39.58 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  38.13 
 
 
187 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  46.51 
 
 
152 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  36.69 
 
 
183 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  35.62 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  36.91 
 
 
161 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  47.15 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  45.19 
 
 
160 aa  97.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  37.59 
 
 
157 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  38.62 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  33.57 
 
 
164 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  40.17 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  38.6 
 
 
182 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  46.4 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  32.17 
 
 
505 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  35.34 
 
 
176 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  41.5 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  38.51 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  44.44 
 
 
168 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  37.3 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.52 
 
 
196 aa  94  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  41.22 
 
 
158 aa  94  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  41.04 
 
 
152 aa  93.6  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  41.84 
 
 
170 aa  93.6  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  32.17 
 
 
503 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  45.05 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  35.77 
 
 
183 aa  93.2  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  34.9 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  39.5 
 
 
157 aa  92  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  41.53 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.42 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  35.76 
 
 
155 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  41.84 
 
 
154 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  35.82 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  36.09 
 
 
145 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  35.33 
 
 
155 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  36.36 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  36.73 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  36.36 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  46.67 
 
 
161 aa  88.6  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  38.46 
 
 
157 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  35.29 
 
 
504 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  46.67 
 
 
161 aa  88.2  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  32.85 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  36.17 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  45.95 
 
 
181 aa  87.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  36.09 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  41.67 
 
 
178 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>