More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1192 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 158 aa  305  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  62.59 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  56.74 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  57.14 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  51.97 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  55.64 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  58.87 
 
 		 176 aa  136  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  58.62 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  57.62 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  56.16 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  58.77 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  62.41 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  55.86 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  57.6 
 
 		 196 aa  127  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  55.94 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  53.69 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  52.31 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  51.18 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  56.1 
 
 		 181 aa  120  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  56.74 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  54.73 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  55.12 
 
 		 184 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  62.73 
 
 		 207 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  53.42 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  50.97 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  58.44 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  55.38 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  43.31 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  55.47 
 
 		 205 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  55.17 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  54.2 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  55.17 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  47.73 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  55.86 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  40.15 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  62.5 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  62.5 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  61.29 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  62.5 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  36.42 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  41.22 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  41.86 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  36.49 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  36.49 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  43.17 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.49 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  45.86 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  36.49 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.49 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  91.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  42.75 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  36.49 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  36.87 
 
 		 190 aa  90.5  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  35.62 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  35.04 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  36.49 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  35.04 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  38.03 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  35.81 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.81 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.81 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  34.93 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  33.56 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  35.66 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  34.42 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  39.6 
 
 		 153 aa  87  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  39.01 
 
 		 161 aa  87  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  35.92 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  34 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  36.41 
 
 		 188 aa  85.1  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  40.14 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  41.48 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  34.46 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  40.58 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  34.67 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  30.14 
 
 		 154 aa  84  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  30.14 
 
 		 154 aa  84  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  36.5 
 
 		 152 aa  84  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  41.43 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  32.41 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  31.79 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  36.73 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  34.97 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  32.37 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  43.09 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  35.37 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  34.9 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  38.85 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  32.82 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  40.91 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  37.5 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  34.53 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  29.41 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  32.47 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  28.1 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  36.43 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  35.14 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>