More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0729 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 176 aa  332  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  61.31 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  59.04 
 
 		 196 aa  177  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  58.08 
 
 		 181 aa  175  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  57.96 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  57.58 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  57.06 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  57.24 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  50.84 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  53.49 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  50.6 
 
 		 170 aa  147  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  65.52 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  57.74 
 
 		 173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  56.33 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  57.05 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  57.25 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  48.09 
 
 		 207 aa  133  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  55.56 
 
 		 148 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  61.27 
 
 		 182 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  58.82 
 
 		 205 aa  117  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  58.87 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  52.32 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  60.16 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  58.87 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  58.14 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  55.8 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  66.1 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  60.87 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  55.04 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  39.05 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  60.63 
 
 		 164 aa  97.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  45.3 
 
 		 160 aa  94.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  65.48 
 
 		 148 aa  94.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  36.81 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  62.5 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  62.5 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  62.5 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  36.96 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  39.53 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  39.53 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  39.53 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.53 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  56.18 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  34.07 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  39.53 
 
 		 157 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  38.71 
 
 		 161 aa  88.2  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  38.76 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  44.95 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.76 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.76 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  37.98 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  40.43 
 
 		 141 aa  86.3  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  42.06 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  38.76 
 
 		 157 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  57.84 
 
 		 149 aa  84.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  41.38 
 
 		 169 aa  84  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  39.06 
 
 		 157 aa  84.3  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.29 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  41.46 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  43.48 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  42.97 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  40.48 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  62.9 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  34.92 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  31.41 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  42.2 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  42.2 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  43.2 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  39.66 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  39.66 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  39.68 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  36.59 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  35.56 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  36.81 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  44.55 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  39.52 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  41.88 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  45.3 
 
 		 549 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  45.3 
 
 		 542 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.35 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  48 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.11 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  38.46 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  46.73 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  40.91 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  41.94 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  37.5 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  38.46 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  41 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  38.53 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  35.83 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  38.46 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  39.45 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  39.45 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  36.11 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  39.45 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  39.45 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>