More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0940 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  67.4 
 
 		 188 aa  240  9e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  42.11 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  40.33 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  42.69 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  40.72 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.78 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  43.27 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  104  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  40.74 
 
 		 160 aa  104  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.23 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 184 aa  101  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  41.76 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  41.95 
 
 		 157 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  42.01 
 
 		 147 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  38.01 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  40.8 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  33.14 
 
 		 156 aa  90.9  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  36.9 
 
 		 159 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  34.07 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  34.15 
 
 		 161 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  38.65 
 
 		 207 aa  88.2  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  36.13 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  33.72 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  34.59 
 
 		 163 aa  85.9  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  34.38 
 
 		 153 aa  85.5  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  36.13 
 
 		 158 aa  85.5  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  34.34 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  38.35 
 
 		 184 aa  84.3  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  43.38 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  40.52 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  37.09 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  36 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  36.21 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  34.46 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  39.04 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  31.58 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  34.46 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  37.59 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  37.4 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  35.82 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  35.82 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  37.75 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  34.57 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  60.94 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  39.49 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  30.63 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  30.67 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  30.63 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  31.95 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  35.67 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  38.41 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  48.81 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  33.82 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  31.47 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  50.68 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  36.17 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  35.42 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  42.34 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  34.84 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  46.25 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  30.49 
 
 		 157 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  32.34 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  35.1 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  31.45 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  33.78 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  30.41 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  29.45 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  29.45 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  29.45 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  36.48 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  29.45 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  35.42 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  32.65 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  38.81 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  29.27 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  29.27 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  28.49 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  35.61 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  32.88 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  41.57 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  41.57 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  41.57 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  28.83 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  41.46 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  31.97 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  33.12 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  28.83 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  28.83 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  36.31 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  30.46 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  37.4 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  47.37 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  32.3 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  33.09 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  33.61 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  32.79 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  38.84 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>