More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0902 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  281  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  68 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  63.64 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  64.03 
 
 		 170 aa  167  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  61.43 
 
 		 165 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  68.35 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  60.39 
 
 		 181 aa  161  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  68.97 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  56.6 
 
 		 196 aa  156  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  57.43 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  59.03 
 
 		 170 aa  150  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  64.79 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  56.86 
 
 		 184 aa  146  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  60 
 
 		 173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  62.5 
 
 		 211 aa  140  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  60.83 
 
 		 195 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  59.52 
 
 		 207 aa  134  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  66.67 
 
 		 205 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  62.07 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  57.46 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  64.49 
 
 		 182 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  57.55 
 
 		 158 aa  123  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  59.29 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  58.16 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  56.85 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  63.16 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  41.71 
 
 		 188 aa  103  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  68.37 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  66.38 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  47.06 
 
 		 190 aa  97.8  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  46.15 
 
 		 184 aa  98.2  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  43.75 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  51.61 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  55 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  38.3 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  63.49 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  39.72 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  39.72 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.32 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  41.89 
 
 		 152 aa  87.4  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  48.51 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  38.97 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  38.69 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  40.56 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  42.74 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  39.44 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.63 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.69 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  38.85 
 
 		 157 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  38.73 
 
 		 173 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.96 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  42.11 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  39.44 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  37.96 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.41 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  39.37 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  37.23 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.96 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  37.96 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  38.97 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  36.61 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  37.41 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  35.33 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  42.42 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  37.32 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  37.32 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  30.07 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  32.84 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  42.5 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  32.39 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  32.39 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  37.32 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  37.68 
 
 		 148 aa  76.6  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  41.23 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  31.34 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.83 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  36.81 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  40 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  42.45 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  38.28 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  42.45 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  31.39 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  32.56 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  36.81 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  40.59 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  35.66 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  38.28 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  39.13 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  56.03 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  52.78 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  52.78 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  52.78 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  45 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>