More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01741 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  100 
 
 
172 aa  347  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  67.06 
 
 
166 aa  213  9e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  65.19 
 
 
163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  55.33 
 
 
174 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  55.33 
 
 
174 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17521  ATPase or kinase  51.18 
 
 
170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  46.94 
 
 
145 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  50.35 
 
 
145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  48.25 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  46.85 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  47.83 
 
 
154 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  44.93 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  43.88 
 
 
152 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  45.53 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  42.65 
 
 
152 aa  95.9  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  43.97 
 
 
160 aa  91.3  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  43.08 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  42.36 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  40.94 
 
 
149 aa  88.2  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  47.24 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  41.86 
 
 
152 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  41.86 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  42.5 
 
 
141 aa  85.9  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  40.71 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  41.53 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  45.83 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  40.68 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  42.37 
 
 
161 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  42.37 
 
 
161 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  65.45 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  44 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  39.83 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  79  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  40 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  35.81 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  45.6 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  38.6 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  38.6 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.01 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  45.6 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  52.86 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  32.69 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.53 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  44.66 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  42.15 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  36.44 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  38.78 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  38.14 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  35.46 
 
 
207 aa  74.3  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  36.96 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  37.59 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.43 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  35.88 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  32.28 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  30.91 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  37.4 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  48.75 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  38.24 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  32.39 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  36.59 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  38.33 
 
 
168 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  38.41 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  39.32 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  35.66 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  35.66 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  33.9 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  36.57 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2004  hypothetical protein  41.38 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  37.41 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  37.06 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  42.37 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  31.9 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  36.57 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  40.35 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  48.72 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  32.5 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  32.5 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  33.59 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  45.24 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  36.94 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  44.58 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  33.56 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2083  hypothetical protein  40.52 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  37.6 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  33.56 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  33.56 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  40.91 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  36.57 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  33.56 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  39.33 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  36.57 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  34.97 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  37.78 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0439  protein of unknown function UPF0079  37.82 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  36.89 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  35.94 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>