More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0439 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0439  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 153 aa  294  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2004  hypothetical protein  44.29 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2083  hypothetical protein  44.29 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  45.1 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  39.06 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  39.67 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2756  protein of unknown function UPF0079  43.17 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  40.97 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  37.76 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  38.46 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  43.93 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  36.84 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  38.03 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  40.15 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  39.44 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  41.82 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  42.66 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  38.46 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  35.45 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  40.54 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  37.23 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  37.23 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  40.35 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  38.71 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  37.96 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  37.23 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  39.57 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  35.16 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  38.69 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  38.69 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  38.69 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  37.23 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  38.69 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  38.69 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  34.71 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  38.69 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  38.69 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  38.69 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  38.69 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  37.23 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  37.23 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  37.23 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  37.23 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  39.47 
 
 		 174 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  31.62 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  39.58 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  41.12 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  39.09 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  46.73 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  39.82 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  34.11 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  33.79 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  38.06 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  33.9 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  40.57 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  37.14 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  37.14 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  37.14 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  37.14 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  46.15 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  38.32 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  33.9 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  36.51 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  45.79 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  48.28 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  38.96 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  40.58 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  37.82 
 
 		 172 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  34.95 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  34.95 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  42.59 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17521  ATPase or kinase  37.5 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  38.52 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  43.24 
 
 		 504 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  37.61 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  32.46 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  36.69 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  38.38 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  40.78 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  36.19 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  29.29 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  29.29 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  36.21 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  42.15 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  42.16 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  40.43 
 
 		 503 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  40.37 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  30.17 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  33.03 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  43.22 
 
 		 549 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  43.59 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  37.27 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  39.66 
 
 		 188 aa  67  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  43.22 
 
 		 542 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>