More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1296 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  99.38 
 
 		 161 aa  324  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  42.67 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1492  hypothetical protein  37.68 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  36 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 164 aa  97.1  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  37.58 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  37.4 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  41.46 
 
 		 155 aa  94  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  37.4 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.4 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  36.64 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  36.64 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  36.64 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.64 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.5 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  42.61 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  38.28 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  42.86 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  39.17 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 131 aa  90.9  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.55 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  35.97 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.64 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  36.76 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  38.89 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1157  hypothetical protein  47.92 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  33.09 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  40.91 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  37.4 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  35.67 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  34.93 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  34.59 
 
 		 150 aa  87.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  35.85 
 
 		 161 aa  87  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  39.5 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  34.59 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.89 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  35.62 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  37.23 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  35.71 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  40.16 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  33.57 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  43.64 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  38.21 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  36.5 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  35 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  37.21 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  35.59 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  37.7 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  39.66 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  33.81 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  34.09 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  39.69 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.66 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  37.7 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  39.52 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  35.07 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  37.12 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  37.6 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  38.02 
 
 		 503 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  42.73 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  36.92 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  31.69 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  41.12 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  36.92 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  37.1 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  36.23 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  37.61 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  39.1 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  33.77 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  32.12 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  35.71 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  34.93 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  37.04 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  34.04 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  36.61 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  39.5 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  32.41 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  34.04 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  38.61 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  41.41 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  38.64 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  37.5 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  37.5 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  33.87 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  41.9 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  32.39 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  38.89 
 
 		 523 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  38.66 
 
 		 509 aa  77.4  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  34.07 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  33.87 
 
 		 183 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  37.3 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  35.54 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  35.54 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  40.5 
 
 		 504 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  39.82 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  35.25 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>