More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0046 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  283  7e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  76.3 
 
 		 141 aa  212  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  45.71 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.19 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  43.28 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  35.56 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  35.56 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  39.86 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  40.74 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  45.26 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.93 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  42.19 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  36.96 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  41.98 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  42.74 
 
 		 155 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  37.41 
 
 		 153 aa  87  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  40.43 
 
 		 176 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  39.67 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  39.67 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  39.67 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  39.67 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  39.67 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  42.74 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  44.55 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  38.73 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  35.34 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  39.39 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  33.08 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  40.94 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  38.1 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  40 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  38.41 
 
 		 181 aa  84.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  35.25 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  36.51 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  43.1 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  40.43 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  38.33 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  38.33 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  38.33 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  38.33 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  38.33 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  38.33 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  38.33 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  38.33 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  39.71 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  38.33 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  44.14 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  40.43 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  35.96 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  41.18 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  35.56 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  33.09 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  37.12 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  37.12 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  35.61 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  37.12 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  35.61 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  37.12 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  42.73 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  38.97 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  40.3 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  41.35 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  42.31 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  49.44 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  36.45 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  37.1 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  34.31 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  43.75 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1157  hypothetical protein  38.24 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  43.93 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  39.39 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  44.9 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  37.96 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  38.64 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  39.01 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  39.47 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  36.92 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  37.59 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  36.61 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  47.12 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  37.29 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  38.52 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  35.81 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  32.85 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  36.59 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  39.22 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  39.42 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.84 
 
 		 196 aa  80.1  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  39.22 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  41.77 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  37.76 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  42.5 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  43.41 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  32.03 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.01 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  40 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  32.28 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>