More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0145 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  331  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  67.06 
 
 
172 aa  213  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  68.1 
 
 
163 aa  187  7e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  60.9 
 
 
174 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  59.4 
 
 
174 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17521  ATPase or kinase  50.31 
 
 
170 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  47.52 
 
 
145 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  47.52 
 
 
145 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  50.35 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  46.81 
 
 
145 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  47.79 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  43.48 
 
 
152 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  43.07 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  43.07 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  42.22 
 
 
152 aa  97.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  42.07 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  40.97 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  42.28 
 
 
144 aa  95.5  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  44.12 
 
 
168 aa  94.4  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  48.51 
 
 
155 aa  94.4  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  38.85 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  38.52 
 
 
152 aa  88.2  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  41.01 
 
 
153 aa  87.4  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  41.98 
 
 
164 aa  87  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.04 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  58.57 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  53.75 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  41.98 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2083  hypothetical protein  40.58 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  42.54 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  39.01 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.01 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  38.35 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  43.17 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2004  hypothetical protein  40.58 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  39.52 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  41.22 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  42.02 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  46.43 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  79  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  37.32 
 
 
141 aa  79  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  44.55 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  34.78 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  34.78 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  34.75 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  41.44 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  34.81 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  37.59 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  34.81 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  36.05 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  34.81 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  45.05 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  47.62 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  37.61 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  47.62 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  34.07 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  34.59 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  33.33 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  47.62 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0439  protein of unknown function UPF0079  40.48 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  33.8 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  39.57 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  41.67 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.72 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  34.81 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  34.81 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  36.51 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  44.86 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  36.51 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  40.35 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  34.81 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  47.67 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  33.6 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  39.86 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  38.79 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  45 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.61 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  37.76 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  43.9 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  33.82 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  44.12 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  38.52 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  38.52 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  38.73 
 
 
504 aa  73.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  29.23 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.75 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  38.46 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  34.44 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  35.77 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  41.96 
 
 
523 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  39.34 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  33.85 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  36.22 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  41.8 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  43.48 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  47.5 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  37.78 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  33.09 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.595052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>