More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2605 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  322  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  70.63 
 
 
170 aa  204  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  64.58 
 
 
147 aa  164  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  57.75 
 
 
153 aa  163  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  54.09 
 
 
179 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  57.24 
 
 
176 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  58.87 
 
 
160 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  61.87 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  57.62 
 
 
163 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  53.21 
 
 
196 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  58.02 
 
 
181 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  52.94 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  51.63 
 
 
184 aa  134  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  55.38 
 
 
157 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  45.09 
 
 
195 aa  130  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  56.15 
 
 
211 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  54.17 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  51.57 
 
 
173 aa  123  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  59.73 
 
 
182 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  57.85 
 
 
207 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  58.27 
 
 
178 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  53.02 
 
 
157 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  59.52 
 
 
205 aa  121  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  52.23 
 
 
169 aa  120  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  53.55 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  40.11 
 
 
190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  54.4 
 
 
170 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  41.01 
 
 
188 aa  107  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  41.55 
 
 
157 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.55 
 
 
157 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  50.39 
 
 
154 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  40.85 
 
 
157 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  40.85 
 
 
157 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  41.55 
 
 
157 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  40.85 
 
 
157 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.85 
 
 
157 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  41.55 
 
 
157 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  41.55 
 
 
157 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  42.07 
 
 
157 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  42.76 
 
 
157 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  63.64 
 
 
146 aa  99.8  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  44.37 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.26 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  42.95 
 
 
164 aa  98.2  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  36.48 
 
 
161 aa  97.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  44.97 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  33.1 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  37.76 
 
 
160 aa  94.4  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  41.73 
 
 
163 aa  94.4  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  41.22 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  47.2 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.17 
 
 
153 aa  92.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  56.59 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  37.14 
 
 
160 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  33.55 
 
 
169 aa  88.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  51.22 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  40.26 
 
 
152 aa  88.2  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  32.87 
 
 
154 aa  88.2  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  32.87 
 
 
154 aa  88.2  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  38.85 
 
 
163 aa  87.8  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  49.61 
 
 
154 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  36.6 
 
 
158 aa  87  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.01 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  42.75 
 
 
144 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  30.72 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  30.72 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  37.78 
 
 
141 aa  84.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  38.13 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  37.59 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 
174 aa  84.3  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  34.36 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  31.85 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  36.88 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  44.12 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  51.61 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  36.62 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  51.61 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  51.61 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  33.1 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  36.92 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  44.9 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  48.51 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  36.72 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  37.8 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  35.04 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  35.29 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  30.47 
 
 
148 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  38.36 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  29.81 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  32.5 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  35.94 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1295  ATPase or kinase  40.82 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  28.15 
 
 
149 aa  79  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  34.53 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.55 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  43.64 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  32.84 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  33.96 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  38.1 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>