More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0611 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  293  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  77.46 
 
 
147 aa  197  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  65.33 
 
 
170 aa  193  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  64.33 
 
 
179 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  66.88 
 
 
160 aa  180  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  59.04 
 
 
196 aa  174  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  70.71 
 
 
163 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  55.48 
 
 
181 aa  164  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  57.23 
 
 
184 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  57.96 
 
 
176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  58.82 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  48.88 
 
 
211 aa  149  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  56.62 
 
 
157 aa  146  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  63.64 
 
 
148 aa  140  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  61.87 
 
 
178 aa  140  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  46.55 
 
 
195 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  60.18 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  54.78 
 
 
173 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  58.11 
 
 
157 aa  136  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  56.74 
 
 
158 aa  134  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  57.93 
 
 
169 aa  127  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  59.42 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  58.67 
 
 
205 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  44.2 
 
 
207 aa  124  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  53.73 
 
 
154 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  57.48 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  71.57 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  63.04 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  40.72 
 
 
190 aa  108  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  41.13 
 
 
153 aa  107  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  40.85 
 
 
160 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  50.36 
 
 
168 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  38.46 
 
 
188 aa  104  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  63.64 
 
 
164 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  42.36 
 
 
155 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  40.56 
 
 
164 aa  100  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  40.28 
 
 
169 aa  100  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  40.82 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  42.34 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  53.68 
 
 
155 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  53.68 
 
 
155 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  53.68 
 
 
155 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  34.69 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.6 
 
 
150 aa  97.1  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  41.3 
 
 
173 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  36.05 
 
 
152 aa  95.5  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  57.65 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  40.69 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  39.71 
 
 
160 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  43.28 
 
 
141 aa  93.6  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  38.51 
 
 
184 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  49.04 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  33.78 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  37.67 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  38.78 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  38.3 
 
 
159 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  34 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  34 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  38.35 
 
 
174 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  38.85 
 
 
158 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  37.78 
 
 
174 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  32.39 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  42.55 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 
153 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  36.05 
 
 
164 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  36.05 
 
 
164 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  36.96 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  43.38 
 
 
163 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  62.34 
 
 
148 aa  87  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  30.46 
 
 
156 aa  87  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  38.58 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  35.77 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  36.81 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  36.97 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  36.59 
 
 
145 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  34.38 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  38.19 
 
 
163 aa  84  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  36.05 
 
 
160 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  37.93 
 
 
174 aa  84  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  36.97 
 
 
145 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  43.38 
 
 
168 aa  83.6  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  44.26 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.48 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  35.48 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  35.48 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  37.5 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  35.48 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  36.67 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  36.11 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  41.67 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  38.06 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  33.33 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  42.62 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  34.81 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  36.88 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  36.11 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  54.11 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  37.68 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>