More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4961 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 143 aa  297  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  55.07 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  48.85 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  48.84 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  54.95 
 
 		 135 aa  120  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  42.96 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  44.72 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  48.51 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  41.35 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0073  protein of unknown function UPF0079  34.06 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  40.91 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  41.44 
 
 		 155 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  39.85 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  40.8 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  41.6 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  40.8 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  40.8 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  40.8 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  33.57 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  40.16 
 
 		 176 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  41.6 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  40.37 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  40.37 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  39.1 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  40.37 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  40.8 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  40.8 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  43.44 
 
 		 169 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3215  protein of unknown function UPF0079  45.05 
 
 		 194 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  41.46 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.09 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  37.84 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  41.38 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  44.34 
 
 		 161 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0723  hypothetical protein  41.9 
 
 		 184 aa  87.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0747  hypothetical protein  45.45 
 
 		 192 aa  87.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  39.47 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  39.09 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  39.09 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  38.98 
 
 		 192 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  42.59 
 
 		 184 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  37.84 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  44.68 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  38.66 
 
 		 192 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  38.52 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  38.53 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  43.02 
 
 		 156 aa  84.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  35.48 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  29.5 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  38.53 
 
 		 183 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  29.5 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  39.53 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.59 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  33.9 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  33.9 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  38.14 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  42.42 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.7 
 
 		 161 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  36.51 
 
 		 155 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0734  hypothetical protein  42.59 
 
 		 184 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  34.43 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2481  hypothetical protein  42.59 
 
 		 183 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0482851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2610  hypothetical protein  42.59 
 
 		 198 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  36.89 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  37.14 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  38.68 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5894  hypothetical protein  41.67 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  37.89 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  43.43 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  41.84 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  38.68 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  36.51 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0666  hypothetical protein  46.51 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.739663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2501  hypothetical protein  46.51 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0366  hypothetical protein  46.51 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  42.7 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  37.38 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1065  hypothetical protein  46.51 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  37.5 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  40.5 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  40.19 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  46.51 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0908  hypothetical protein  46.51 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0911  hypothetical protein  46.51 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  36.45 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  33.59 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  38.78 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  37.61 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  37.86 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  38.24 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  36.19 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  36.19 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  36.19 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  36.19 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  36.19 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>