More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0101 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  68.1 
 
 
166 aa  204  6e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  65.19 
 
 
172 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  52.83 
 
 
174 aa  174  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  52.2 
 
 
174 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17521  ATPase or kinase  51.27 
 
 
170 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  46.81 
 
 
145 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  50.72 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  46.81 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  46.81 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  47.76 
 
 
165 aa  98.2  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  50.43 
 
 
152 aa  97.1  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  46.21 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  47.76 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  51.92 
 
 
154 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  46.36 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  42.19 
 
 
170 aa  90.5  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  49.04 
 
 
165 aa  90.5  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  45.9 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  43.38 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  45.54 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  46.55 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  44.83 
 
 
152 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  44.78 
 
 
161 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  44.83 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  42.65 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  46.53 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  46.9 
 
 
160 aa  86.3  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  40.8 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  41.84 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  36.94 
 
 
154 aa  84.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  36.94 
 
 
154 aa  84.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  49.44 
 
 
154 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  44.78 
 
 
167 aa  84.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  41.74 
 
 
158 aa  84  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  42.75 
 
 
160 aa  84  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  41.38 
 
 
149 aa  84  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  40.18 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  41.01 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  41.23 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  42.45 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  38.83 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  37.59 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  45.83 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  43.88 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  41.98 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  42.66 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  42.34 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  41.94 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  55.84 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  40.18 
 
 
195 aa  80.5  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  40.52 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.42 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  42.45 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.13 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  38.79 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  41.44 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  40.19 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  41.9 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  41.44 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  37.78 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  39.69 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  40.83 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  43.18 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  44.34 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  46.32 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  36.15 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  43.69 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  42.06 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  55.84 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  57.14 
 
 
157 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  37.68 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0439  protein of unknown function UPF0079  42.24 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  48.57 
 
 
143 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.09 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  39.09 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  35.97 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  35.97 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  40.91 
 
 
148 aa  77  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  35.37 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  39.83 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  40.59 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  48.75 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  38.6 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  43.09 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  48.75 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  48.75 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  42.06 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  34.4 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  37.72 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  36.3 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  36.5 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  39.1 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>