More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2895 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  384  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  69.95 
 
 
211 aa  266  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  48.19 
 
 
207 aa  160  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  52.51 
 
 
176 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  50.86 
 
 
196 aa  154  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  48.3 
 
 
160 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  48.31 
 
 
181 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  49.43 
 
 
184 aa  141  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  45.66 
 
 
153 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  46.24 
 
 
179 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  53.07 
 
 
205 aa  134  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  48.88 
 
 
173 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  57.85 
 
 
170 aa  131  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  55.81 
 
 
170 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  46.63 
 
 
165 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  44.97 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  49.08 
 
 
148 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  43.53 
 
 
147 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  48.05 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  46.62 
 
 
157 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  53.54 
 
 
157 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  51.18 
 
 
158 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  49.29 
 
 
169 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  51.16 
 
 
178 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  49.62 
 
 
157 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  46.72 
 
 
154 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
160 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  50.4 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  51.49 
 
 
164 aa  91.7  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  55.34 
 
 
146 aa  90.9  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  40.8 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  45.19 
 
 
168 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  41.67 
 
 
155 aa  88.6  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  39.39 
 
 
163 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  39.39 
 
 
163 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  39.39 
 
 
163 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  36.72 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  48.12 
 
 
155 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  48.12 
 
 
155 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  33.51 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  48.12 
 
 
155 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  39.1 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  46.56 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  33.16 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.17 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  38.17 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  38.17 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.17 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  41.67 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  38.17 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  45.13 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  39.37 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  41.07 
 
 
153 aa  82  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  38.17 
 
 
157 aa  82  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  38.17 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.17 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  38.89 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  41.22 
 
 
152 aa  80.5  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  39.37 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  40.18 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  37.4 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  41.23 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  52.76 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  43.36 
 
 
152 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  37.75 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  38.94 
 
 
158 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  40.18 
 
 
164 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  40.18 
 
 
164 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
167 aa  79  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  38.81 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  41.41 
 
 
144 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  35.34 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  38.17 
 
 
159 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  40.6 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  35.82 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  39.71 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  34.48 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  37.69 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.47 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  39.64 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  35.11 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  43.12 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  37.9 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  37.3 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  38.89 
 
 
152 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  34.55 
 
 
156 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  28 
 
 
154 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  28 
 
 
154 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  37.6 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  36.28 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  40.35 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  41.23 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  40.19 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  31.58 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  32.24 
 
 
161 aa  72  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  40.83 
 
 
147 aa  72  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  39.55 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  44.25 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>