More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23150 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  100 
 
 		 205 aa  388  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  61.18 
 
 		 179 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  61.35 
 
 		 160 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  55.48 
 
 		 170 aa  155  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  58.67 
 
 		 153 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  51.96 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  49.46 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  66.94 
 
 		 196 aa  150  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  59.29 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  63.64 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  65.71 
 
 		 148 aa  144  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  55.76 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  56.95 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  66.37 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  54.93 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  57.93 
 
 		 147 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  56.85 
 
 		 163 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  51.7 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  53.9 
 
 		 173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  54.55 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  51.46 
 
 		 157 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  53.21 
 
 		 157 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  56.43 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  54.05 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  55.92 
 
 		 146 aa  104  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  58.97 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  53.79 
 
 		 178 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  37.91 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  39.51 
 
 		 190 aa  94.7  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  59.35 
 
 		 148 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  41.56 
 
 		 159 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  49.61 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  39.35 
 
 		 157 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  39.35 
 
 		 157 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  39.35 
 
 		 157 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.35 
 
 		 157 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  63.25 
 
 		 164 aa  88.2  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.41 
 
 		 160 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  44.86 
 
 		 141 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  39.35 
 
 		 157 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  37.84 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  38.71 
 
 		 157 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.71 
 
 		 157 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.06 
 
 		 157 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  38.78 
 
 		 141 aa  84.7  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  38.06 
 
 		 157 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  35.67 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  39.49 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  45.05 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  51.16 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  40.88 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  37.42 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  45.13 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  45.36 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  40.74 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  40.74 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  42.74 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  36.65 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  40.37 
 
 		 146 aa  77.8  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1157  hypothetical protein  36.7 
 
 		 152 aa  77.8  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  49.54 
 
 		 144 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  51.95 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  51.95 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  51.95 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  43.12 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  33.86 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  36.31 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  54.61 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  34.65 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  34.62 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  40.32 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  45.6 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  34.64 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  40.95 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  36.18 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  34.93 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  41.33 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  32.26 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  37.62 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  29.7 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  39.62 
 
 		 172 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  35.03 
 
 		 163 aa  72  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  35.03 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  31.25 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  38.26 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  33.87 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  34.27 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  35.16 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.71 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  34.29 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  35.92 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  31.85 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  35.92 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  38.54 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  34.38 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  42.86 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  38.54 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>