More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  100 
 
 		 196 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  66.86 
 
 		 160 aa  207  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  58.92 
 
 		 181 aa  197  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  61.11 
 
 		 184 aa  191  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  59.04 
 
 		 176 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  59.04 
 
 		 153 aa  174  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  56.21 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  59.43 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  60.12 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  52.1 
 
 		 170 aa  157  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  53.72 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  59.63 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  48.13 
 
 		 211 aa  144  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  47.43 
 
 		 195 aa  141  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  63.48 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  61.21 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  56.6 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  53.12 
 
 		 157 aa  128  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  59.59 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  59.38 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  63.93 
 
 		 178 aa  121  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  66.94 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  62.02 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  39.58 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  57.6 
 
 		 158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  61.29 
 
 		 157 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  55.65 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  39.78 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  65.81 
 
 		 146 aa  104  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  50.76 
 
 		 154 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  64.41 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  64.2 
 
 		 148 aa  93.2  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  49.24 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  91.7  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  44.54 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  42.28 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  42.06 
 
 		 141 aa  85.9  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  43.44 
 
 		 164 aa  86.3  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  42.42 
 
 		 163 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  41.89 
 
 		 167 aa  85.1  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  33.97 
 
 		 160 aa  85.1  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  34.21 
 
 		 161 aa  85.1  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  35.43 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  52.17 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  30.19 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  30.19 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  38.16 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  55.42 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  38.52 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  40.91 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  55.42 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  38.52 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  55.42 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  46.15 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  50.47 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  32.92 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  43.88 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  34.57 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  38.33 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  39.84 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  32.52 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  41.88 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  39.52 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  43.1 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  28.07 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  40.35 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.51 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  37.29 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  38.14 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  32.09 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  41.53 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  37.23 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  40.54 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  42.24 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  33.33 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  42.24 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  37.61 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  38.46 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  35.06 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  37.61 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  39.32 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.46 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  37.61 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  38.52 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  37.6 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  37.61 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.61 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.61 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  37.61 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  40.37 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  38.62 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6554  protein of unknown function UPF0079  45.29 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  42.98 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  39.62 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  39.82 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  38.6 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  40.16 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  41.96 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>