More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0998 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0998  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 182 aa  348  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  61.49 
 
 		 160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  60.38 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  61.04 
 
 		 176 aa  161  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  61.49 
 
 		 179 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  56.14 
 
 		 196 aa  160  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  66.67 
 
 		 153 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  55.97 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  58.82 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  59.44 
 
 		 165 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  60.13 
 
 		 163 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  62.67 
 
 		 147 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  56.73 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  56.12 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  46.93 
 
 		 195 aa  137  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  51.81 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  62.75 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  45.74 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  61.34 
 
 		 157 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  56.58 
 
 		 157 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  60.8 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3855  hypothetical protein  57.97 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  54.11 
 
 		 157 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0561  hypothetical protein  68.7 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  0.678738 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23150  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  56.43 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.282088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4459  protein of unknown function UPF0079  70 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  40.12 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  41.01 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1713  protein of unknown function UPF0079  58.26 
 
 		 170 aa  104  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  44.76 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4245  hypothetical protein  61.83 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  hitchhiker  0.00436804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  50.4 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  43.8 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 160 aa  97.8  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  39.35 
 
 		 152 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  39.86 
 
 		 161 aa  94.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  45.61 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13456  hypothetical protein  51.64 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00125594  hitchhiker  0.000164023 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  37.91 
 
 		 157 aa  91.3  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.91 
 
 		 157 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  41.67 
 
 		 159 aa  91.3  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  37.91 
 
 		 157 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  37.91 
 
 		 157 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  41.13 
 
 		 164 aa  91.3  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  41.13 
 
 		 164 aa  91.3  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  41.83 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  34.97 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  32.9 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  32.9 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  43.61 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  37.25 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  36.6 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  43.65 
 
 		 152 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  37.91 
 
 		 157 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  41.27 
 
 		 152 aa  88.6  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.6 
 
 		 157 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  37.25 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.25 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  43.1 
 
 		 141 aa  87.8  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  40.16 
 
 		 163 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1175  hypothetical protein  57.5 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208061  normal  0.0432668 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  40.8 
 
 		 157 aa  85.9  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1148  hypothetical protein  57.5 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0675046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1165  hypothetical protein  57.5 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.51545 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  33.59 
 
 		 157 aa  85.5  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  40.16 
 
 		 163 aa  85.5  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  43.48 
 
 		 149 aa  84.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0880  protein of unknown function UPF0079  61.4 
 
 		 148 aa  84.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  40.94 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  36.08 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  40.16 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  37.98 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  41.75 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  42.24 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  30.82 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  31.58 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  40.87 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  42.2 
 
 		 141 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  80.9  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  46.6 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  33.82 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  37.93 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  39.29 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4932  hypothetical protein  56.34 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  38.98 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  38.98 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  44.35 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  35.9 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  42.73 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  39.81 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  41.53 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  29.49 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  39.66 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  39.62 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  41.07 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  39.13 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  34.35 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>