More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1606 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  77.05 
 
 		 529 aa  741    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  73.18 
 
 		 542 aa  723    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  73.37 
 
 		 549 aa  748    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  90.66 
 
 		 514 aa  902    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  75.4 
 
 		 540 aa  748    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 529 aa  1030    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  55.66 
 
 		 523 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  53.93 
 
 		 562 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  52.3 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  51.68 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  52.08 
 
 		 523 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  50.89 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  50.49 
 
 		 506 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  51.11 
 
 		 507 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  49.7 
 
 		 507 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  48.52 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  47.39 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  47.28 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  45.09 
 
 		 509 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  45.93 
 
 		 504 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  45.12 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  50.41 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  43.27 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  45.45 
 
 		 502 aa  354  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  40.08 
 
 		 497 aa  350  4e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  39.04 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  40.11 
 
 		 362 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  41.76 
 
 		 360 aa  210  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  40.27 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  43.11 
 
 		 358 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  40.11 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  41.45 
 
 		 328 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 		 332 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 		 323 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 		 342 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  39.32 
 
 		 327 aa  186  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  39.88 
 
 		 328 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  38.99 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  40.99 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  40.7 
 
 		 341 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 		 346 aa  154  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  36.8 
 
 		 340 aa  153  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  34.92 
 
 		 344 aa  141  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  35.45 
 
 		 338 aa  140  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  33.87 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 		 344 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  31.07 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  34.66 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 		 348 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  32.13 
 
 		 348 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 372 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 		 333 aa  131  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  32.31 
 
 		 387 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  35.81 
 
 		 352 aa  128  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  33.65 
 
 		 341 aa  128  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  32.73 
 
 		 339 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  32.73 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  32.12 
 
 		 339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  30.9 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  31.74 
 
 		 349 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  31.74 
 
 		 349 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  31.74 
 
 		 349 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  30.63 
 
 		 349 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  34.11 
 
 		 340 aa  127  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  32.56 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  32.41 
 
 		 362 aa  126  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  51.7 
 
 		 150 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  32.43 
 
 		 349 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  35.03 
 
 		 357 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  31.52 
 
 		 339 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  35.03 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  33.53 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  31.8 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  33.82 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  32.92 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  32.59 
 
 		 336 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  30.91 
 
 		 339 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  32.16 
 
 		 344 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  32.16 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  32.16 
 
 		 344 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  32.16 
 
 		 344 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 		 340 aa  121  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  32.16 
 
 		 344 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  32.04 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  32.16 
 
 		 344 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  31.87 
 
 		 344 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  34.31 
 
 		 350 aa  120  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  32.38 
 
 		 384 aa  120  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  30.19 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  45.34 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  30.32 
 
 		 333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  30.19 
 
 		 329 aa  119  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 		 345 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  27.44 
 
 		 325 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  31.75 
 
 		 348 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 		 341 aa  118  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  31.86 
 
 		 341 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  30.06 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>