More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1298 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 161 aa  319  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  52.94 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1453  hypothetical protein  57.27 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  48.18 
 
 		 523 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  50.36 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  48.23 
 
 		 504 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  50.75 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  50.75 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  51.3 
 
 		 549 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  46.04 
 
 		 542 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  47.48 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  45.26 
 
 		 540 aa  111  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  45.34 
 
 		 529 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  49.28 
 
 		 503 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  44 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  47.5 
 
 		 562 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  45.95 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  48.23 
 
 		 514 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  46.76 
 
 		 505 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  42.86 
 
 		 506 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  43.57 
 
 		 506 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  43.57 
 
 		 507 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  41.78 
 
 		 505 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  44.95 
 
 		 497 aa  99  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  46.72 
 
 		 176 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  43.44 
 
 		 523 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  40.97 
 
 		 513 aa  97.8  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  40.97 
 
 		 513 aa  97.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  42.86 
 
 		 505 aa  97.1  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  40.85 
 
 		 507 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  44.3 
 
 		 529 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  47.2 
 
 		 472 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  44.22 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  41.43 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  43.97 
 
 		 509 aa  94  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  38.35 
 
 		 167 aa  90.9  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  46.85 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  38.46 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  38.3 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  46.38 
 
 		 502 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  38.71 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  38.3 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  39.01 
 
 		 153 aa  87.8  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  39.55 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  39.55 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  39.55 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  35.37 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  38.58 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  38.3 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  38.3 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  38.3 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  38.3 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  37.1 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  38.3 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  38.3 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  38.3 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  34.69 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  39.55 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  39.55 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  37.68 
 
 		 188 aa  85.5  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  40.13 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  38.64 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  41.67 
 
 		 509 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  27.97 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  27.97 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  38.35 
 
 		 160 aa  84  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  32.43 
 
 		 162 aa  84  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  37.69 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  34.4 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  35.61 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  39.57 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2001  hypothetical protein  45.07 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  40.52 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  34.09 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  35.86 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  35.66 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  34.09 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  35.86 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  34.48 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  36.88 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  35.86 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  37.04 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  34.56 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  32.28 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1082  hypothetical protein  37.91 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  37.19 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  51.4 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  35.77 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  35.07 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  35.29 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  38.71 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  31.36 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  34.75 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  35.77 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  36.64 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  35.04 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  34.46 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  30.88 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  37.68 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>