More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2001 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2001  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  293  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  53.17 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  49.21 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  48 
 
 		 169 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  48 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  51.82 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  42.66 
 
 		 497 aa  106  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  41.26 
 
 		 513 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  41.26 
 
 		 513 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  43.36 
 
 		 509 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  44.29 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  47.46 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  49.09 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  43.92 
 
 		 540 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  47.62 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  40.13 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  42.03 
 
 		 176 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  42.45 
 
 		 523 aa  97.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  42.95 
 
 		 549 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  40.88 
 
 		 503 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  49.6 
 
 		 505 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  45.03 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  40.15 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  40.15 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  40.15 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  40.15 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  40.15 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  40.15 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  40.15 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  40.15 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  52.25 
 
 		 505 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  45.07 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  40.15 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  40.15 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  39.42 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  38.24 
 
 		 157 aa  94.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  40 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  40 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  39.42 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  42.52 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  42.47 
 
 		 542 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  39.42 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  48.67 
 
 		 506 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  39.42 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  39.42 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  43.88 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  40 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  38.36 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  40.62 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  48.31 
 
 		 472 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  47.32 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  41.91 
 
 		 504 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  47.41 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  45.61 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  42.03 
 
 		 505 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  48.11 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  43.36 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  41.18 
 
 		 165 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  43.44 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  42.2 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  42.2 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  44.44 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  51.04 
 
 		 506 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  42.06 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  41.79 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  37.67 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  43.8 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  46.43 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  39.53 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  38.41 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  39.13 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  45.95 
 
 		 523 aa  87  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  38.3 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  38.3 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  38.3 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  41.22 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  36.15 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  50.5 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  39.29 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  45.54 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  52.69 
 
 		 507 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  42.42 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  45.54 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  43.52 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  43.52 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  37.78 
 
 		 160 aa  84.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  37.6 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  42.14 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1951  hypothetical protein  38.04 
 
 		 171 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  43.93 
 
 		 196 aa  84.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  35.46 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  43.08 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  42.59 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  42.59 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  50.93 
 
 		 529 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  47.96 
 
 		 507 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  42.59 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  42.59 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  41.32 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  39.32 
 
 		 154 aa  84.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>