More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0608 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0608  putative signaling membrane protein  100 
 
 
516 aa  1051    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.201434  normal  0.689714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2200  EAL domain protein  34.71 
 
 
529 aa  330  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2526  EAL domain protein  34.31 
 
 
526 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3097  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.9 
 
 
533 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36260  putative signal transduction protein  34.54 
 
 
531 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104592  hitchhiker  0.00880546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1789  EAL domain protein  26.82 
 
 
524 aa  212  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0487  EAL domain-containing protein  30.11 
 
 
544 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.606097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0930  EAL domain-containing protein  32.44 
 
 
520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010678  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3153  EAL domain protein  29.92 
 
 
516 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0547  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.27 
 
 
516 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29688  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3159  EAL domain-containing protein  29.92 
 
 
516 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0492  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.27 
 
 
518 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0500  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.1 
 
 
516 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0533  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.12 
 
 
518 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  29.78 
 
 
529 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00408  conserved inner membrane protein  30.06 
 
 
516 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0386  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.06 
 
 
498 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1677  EAL  31 
 
 
523 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0131  EAL domain containing protein  32.32 
 
 
535 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0518  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  39.55 
 
 
516 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00021587  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0148  EAL domain-containing protein  32.32 
 
 
535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0146  EAL domain-containing protein  32.06 
 
 
532 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85827  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  30.04 
 
 
537 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0571  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  39.93 
 
 
516 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  31.33 
 
 
538 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0509  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  39.93 
 
 
516 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000640721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5097  EAL domain-containing protein  30.84 
 
 
542 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1090  EAL-containing signal transduction protein  27.95 
 
 
530 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0487419  hitchhiker  0.00477361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00412  hypothetical protein  38.26 
 
 
406 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0512  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  39.55 
 
 
516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.491599  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0528  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  39.55 
 
 
516 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000439808  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4608  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  39 
 
 
533 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4659  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  39 
 
 
533 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  39 
 
 
516 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4609  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  39 
 
 
533 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.18383  normal  0.98216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4515  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  38.91 
 
 
533 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1771  hypothetical protein  29.67 
 
 
522 aa  179  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0048  EAL  27.57 
 
 
538 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1709  EAL domain-containing protein  28.31 
 
 
530 aa  178  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  28.85 
 
 
525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  34.76 
 
 
374 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  27.15 
 
 
530 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0265  EAL domain-containing protein  36.82 
 
 
528 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1385  signal transduction protein containing sensor and EAL domains-like protein  37.3 
 
 
522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.41583  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0975  EAL domain protein  27.66 
 
 
538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3267  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.96 
 
 
947 aa  156  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.059115  hitchhiker  0.000153402 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.8 
 
 
777 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.765489  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5564  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.51 
 
 
528 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.718753  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3724  EAL-containing signal transduction protein  31.1 
 
 
536 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.51 
 
 
528 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0233  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  35.6 
 
 
513 aa  153  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03933  hypothetical protein  32.1 
 
 
528 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3931  EAL domain protein  32.1 
 
 
528 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03893  hypothetical protein  32.1 
 
 
528 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3966  EAL domain-containing protein  32.1 
 
 
528 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0738656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0805  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.78 
 
 
706 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2573  RNase II stability modulator  37.6 
 
 
667 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0254  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.29 
 
 
557 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1344  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.8 
 
 
836 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.492796  normal  0.0418259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1723  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.04 
 
 
674 aa  149  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.716751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0537  sensory box/GGDEF family protein  36.48 
 
 
682 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.25 
 
 
1144 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.851066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3966  RNase II stability modulator  37.2 
 
 
667 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0378593  normal  0.0378362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5143  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.18 
 
 
884 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663755  normal  0.026538 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4614  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.69 
 
 
528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3554  RNase II stability modulator  37.2 
 
 
667 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108406  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4303  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.69 
 
 
528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.75 
 
 
1075 aa  148  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.59 
 
 
1101 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3371  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.68 
 
 
767 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1138  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.66 
 
 
827 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0051075  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1281  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.19 
 
 
559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0647762  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2617  EAL domain-containing protein  29.71 
 
 
517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.802408  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06253  sensory transduction protein kinase  36.18 
 
 
763 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1662  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.27 
 
 
450 aa  147  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.235348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2565  two component signal transduction response regulator  38.02 
 
 
703 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0447  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.14 
 
 
549 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.88 
 
 
512 aa  147  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1237  sensory box protein  36.82 
 
 
712 aa  147  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.267434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.55 
 
 
989 aa  147  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4439  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.59 
 
 
657 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  37.02 
 
 
685 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4552  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.52 
 
 
624 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0984  sensory box protein  35.18 
 
 
810 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.84 
 
 
593 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.84 
 
 
593 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2578  EAL domain protein  24.76 
 
 
514 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0787436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0361  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.36 
 
 
1254 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1976  PAS:GGDEF  37.7 
 
 
963 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5122  RNase II stability modulator  36 
 
 
667 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0232161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1326  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.78 
 
 
1002 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.121951  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05448  hypothetical protein  27.64 
 
 
489 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1152  RNase II stability modulator  36.07 
 
 
667 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.584939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  36.29 
 
 
1245 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1562  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.36 
 
 
610 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66295  normal  0.802083 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0917  GGDEF domain-containing protein  32.3 
 
 
765 aa  145  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.394246  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0979  GGDEF domain-containing protein  32.17 
 
 
765 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0220  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  36.44 
 
 
598 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1335  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.63 
 
 
920 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269119  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0672  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.41 
 
 
646 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>