More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2526 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2200  EAL domain protein  82.86 
 
 
529 aa  911    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2526  EAL domain protein  100 
 
 
526 aa  1091    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0608  putative signaling membrane protein  34.96 
 
 
516 aa  333  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.201434  normal  0.689714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3097  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.12 
 
 
533 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36260  putative signal transduction protein  31.5 
 
 
531 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104592  hitchhiker  0.00880546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1789  EAL domain protein  27.36 
 
 
524 aa  207  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0487  EAL domain-containing protein  26.88 
 
 
544 aa  200  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.606097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0518  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  29.48 
 
 
516 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00021587  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0528  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  29.69 
 
 
516 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000439808  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0509  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  29.69 
 
 
516 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000640721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0512  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  29.48 
 
 
516 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.491599  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0571  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  29.48 
 
 
516 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0547  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.06 
 
 
516 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29688  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0492  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.06 
 
 
518 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00408  conserved inner membrane protein  29.86 
 
 
516 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3153  EAL domain protein  29.86 
 
 
516 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0500  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  29.65 
 
 
516 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3159  EAL domain-containing protein  29.86 
 
 
516 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0533  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  29.86 
 
 
518 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0386  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  29.86 
 
 
498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  27.87 
 
 
529 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1677  EAL  28.57 
 
 
523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1709  EAL domain-containing protein  28.82 
 
 
530 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1771  hypothetical protein  27.39 
 
 
522 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0930  EAL domain-containing protein  28.13 
 
 
520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010678  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3724  EAL-containing signal transduction protein  29.93 
 
 
536 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2578  EAL domain protein  23.76 
 
 
514 aa  163  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0787436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1090  EAL-containing signal transduction protein  26.41 
 
 
530 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0487419  hitchhiker  0.00477361 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  26.4 
 
 
530 aa  162  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1385  signal transduction protein containing sensor and EAL domains-like protein  25.84 
 
 
522 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.41583  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2617  EAL domain-containing protein  27.54 
 
 
517 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.802408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00412  hypothetical protein  35.59 
 
 
406 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0975  EAL domain protein  27.32 
 
 
538 aa  160  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  29.56 
 
 
532 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1559  hypothetical protein  32.93 
 
 
532 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  34.32 
 
 
374 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  35.93 
 
 
507 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  35.93 
 
 
507 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  35.93 
 
 
521 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  35.93 
 
 
521 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  35.93 
 
 
521 aa  157  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  27.16 
 
 
525 aa  156  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  35.93 
 
 
521 aa  156  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  28.51 
 
 
501 aa  156  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0048  EAL  32.22 
 
 
538 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.55 
 
 
862 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6367  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.1 
 
 
840 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0265  EAL domain-containing protein  34.02 
 
 
528 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  34.11 
 
 
538 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  34.87 
 
 
965 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  27.31 
 
 
537 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1184  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.19 
 
 
698 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.595122  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.96 
 
 
516 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  36.76 
 
 
486 aa  150  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4608  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.96 
 
 
533 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4515  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.96 
 
 
533 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.46 
 
 
516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4659  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.96 
 
 
533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  33.46 
 
 
516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.46 
 
 
516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4609  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32.59 
 
 
533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.18383  normal  0.98216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  33 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0131  EAL domain containing protein  32.92 
 
 
535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  36.69 
 
 
538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  33.46 
 
 
516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0148  EAL domain-containing protein  32.92 
 
 
535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0429  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.92 
 
 
1487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.89086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0146  EAL domain-containing protein  32.5 
 
 
532 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85827  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0431  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.23 
 
 
1494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0710833  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2389  hypothetical protein  35.47 
 
 
741 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.92 
 
 
1466 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.872186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5097  EAL domain-containing protein  32.64 
 
 
542 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0335  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.97 
 
 
789 aa  146  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  35.51 
 
 
865 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64169e-22 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.17 
 
 
762 aa  146  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  33.08 
 
 
516 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1980  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.69 
 
 
779 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.230064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2620  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  31.8 
 
 
799 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1752  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.8 
 
 
659 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  25.42 
 
 
533 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0378  sensory box protein  32.93 
 
 
1491 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0214422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  26.93 
 
 
528 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3033  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  31.34 
 
 
777 aa  144  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0391  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.4 
 
 
1040 aa  144  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519884  normal  0.119604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  36.16 
 
 
1245 aa  144  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.35 
 
 
650 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5564  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  34.04 
 
 
528 aa  143  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.718753  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0805  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.21 
 
 
706 aa  143  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3966  EAL domain-containing protein  34.04 
 
 
528 aa  143  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0738656 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03893  hypothetical protein  34.04 
 
 
528 aa  143  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03933  hypothetical protein  34.04 
 
 
528 aa  143  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3931  EAL domain protein  34.04 
 
 
528 aa  143  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  26.72 
 
 
504 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  32.43 
 
 
500 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.93 
 
 
593 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2003  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.98 
 
 
770 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000215856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4614  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.04 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1680  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.66 
 
 
1524 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.482461  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4303  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.04 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.47 
 
 
947 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>