More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3097 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_36260  putative signal transduction protein  84.12 
 
 
531 aa  863    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104592  hitchhiker  0.00880546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3097  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  100 
 
 
533 aa  1082    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230012  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0608  putative signaling membrane protein  35.28 
 
 
516 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.201434  normal  0.689714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2200  EAL domain protein  33.08 
 
 
529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2526  EAL domain protein  32.12 
 
 
526 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0487  EAL domain-containing protein  30.92 
 
 
544 aa  237  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.606097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0131  EAL domain containing protein  30.82 
 
 
535 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0148  EAL domain-containing protein  30.6 
 
 
535 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0146  EAL domain-containing protein  30.4 
 
 
532 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85827  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5097  EAL domain-containing protein  31.25 
 
 
542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1789  EAL domain protein  27.72 
 
 
524 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1677  EAL  30.2 
 
 
523 aa  190  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1090  EAL-containing signal transduction protein  28.65 
 
 
530 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0487419  hitchhiker  0.00477361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  29.84 
 
 
529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0048  EAL  28.27 
 
 
538 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0930  EAL domain-containing protein  28.25 
 
 
520 aa  179  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010678  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3153  EAL domain protein  27.95 
 
 
516 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3159  EAL domain-containing protein  27.95 
 
 
516 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0492  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.24 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0533  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.74 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0500  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.45 
 
 
516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0386  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  27.95 
 
 
498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0547  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  27.26 
 
 
516 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29688  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00408  conserved inner membrane protein  27.26 
 
 
516 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0518  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  28.69 
 
 
516 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00021587  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0509  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  28.69 
 
 
516 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000640721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0512  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  28.69 
 
 
516 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.491599  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0571  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  28.69 
 
 
516 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  26.81 
 
 
530 aa  170  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0528  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  28.93 
 
 
516 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000439808  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0975  EAL domain protein  26.35 
 
 
538 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  38.89 
 
 
374 aa  167  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  29.29 
 
 
538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4609  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  24.86 
 
 
533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.18383  normal  0.98216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4608  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  36.11 
 
 
533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  36.11 
 
 
516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1385  signal transduction protein containing sensor and EAL domains-like protein  36.72 
 
 
522 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.41583  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  26.63 
 
 
537 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4659  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  24.95 
 
 
533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  27.14 
 
 
525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4515  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.71 
 
 
533 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  36.69 
 
 
538 aa  163  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2578  EAL domain protein  26.04 
 
 
514 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0787436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1138  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.8 
 
 
827 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0051075  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2617  EAL domain-containing protein  30.32 
 
 
517 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.802408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0265  EAL domain-containing protein  24.9 
 
 
528 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00412  hypothetical protein  37.04 
 
 
406 aa  156  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1709  EAL domain-containing protein  36.67 
 
 
530 aa  156  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1771  hypothetical protein  37.08 
 
 
522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1280  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.4 
 
 
818 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3607  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.69 
 
 
620 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001211  sensory box/GGDEF family protein ScrC (involved in swarmer cell regulation)  35.29 
 
 
776 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2565  two component signal transduction response regulator  37.92 
 
 
703 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.96 
 
 
919 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2343  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.74 
 
 
921 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.762005  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.08 
 
 
929 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34 
 
 
842 aa  148  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0664928  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5143  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.94 
 
 
884 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663755  normal  0.026538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3864  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.98 
 
 
655 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0549958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21190  hypothetical protein  38.02 
 
 
785 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.42827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2848  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.63 
 
 
630 aa  147  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4439  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.41 
 
 
657 aa  147  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  25.96 
 
 
506 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1808  hypothetical protein  37.99 
 
 
726 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.63 
 
 
607 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  26.46 
 
 
506 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1752  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.34 
 
 
659 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0133  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.17 
 
 
1077 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  27.06 
 
 
506 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6367  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.07 
 
 
840 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0397  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.27 
 
 
818 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2526  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.46 
 
 
715 aa  145  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.263284  normal  0.0502692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  33.09 
 
 
506 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4221  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.02 
 
 
733 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4262  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.18 
 
 
861 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0133  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.02 
 
 
1074 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.02 
 
 
1074 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0553  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.98 
 
 
699 aa  144  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1847  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.92 
 
 
648 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0294  putative signaling protein  32.53 
 
 
630 aa  143  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106919  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2589  hypothetical protein  37.04 
 
 
759 aa  144  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03933  hypothetical protein  32 
 
 
528 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3931  EAL domain protein  32 
 
 
528 aa  143  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3966  EAL domain-containing protein  32 
 
 
528 aa  143  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0738656 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03893  hypothetical protein  32 
 
 
528 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.18 
 
 
1036 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4614  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32 
 
 
528 aa  143  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4303  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32 
 
 
528 aa  143  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1271  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.59 
 
 
649 aa  143  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5564  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  32 
 
 
528 aa  143  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.718753  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3319  sensory box protein  34.41 
 
 
733 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3329  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.74 
 
 
643 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0409  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor  34.41 
 
 
925 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.231334  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0463  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  32.64 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.13 
 
 
707 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  32.84 
 
 
516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1559  hypothetical protein  30.64 
 
 
532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0138  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.63 
 
 
1074 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4032  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.75 
 
 
1036 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.661545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>