237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4466 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4466  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  63.49 
 
 		 506 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  43.03 
 
 		 490 aa  148  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  39.05 
 
 		 494 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.59 
 
 		 508 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3049  hypothetical protein  41.62 
 
 		 490 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  35.79 
 
 		 515 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.24 
 
 		 491 aa  125  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.69 
 
 		 503 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.76 
 
 		 493 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  39.88 
 
 		 506 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  40.69 
 
 		 503 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  44.83 
 
 		 496 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  44.83 
 
 		 496 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  44.83 
 
 		 496 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  39.74 
 
 		 503 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  44.52 
 
 		 498 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3054  hypothetical protein  44.52 
 
 		 498 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0529038  normal  0.0190341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  38.95 
 
 		 513 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  41.38 
 
 		 503 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  40 
 
 		 500 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  40.69 
 
 		 503 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  40 
 
 		 504 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40 
 
 		 503 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.31 
 
 		 500 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  39.86 
 
 		 504 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  39.35 
 
 		 500 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  40.74 
 
 		 507 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  35.71 
 
 		 505 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  36.88 
 
 		 506 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  31.2 
 
 		 505 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  36.07 
 
 		 502 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.31 
 
 		 500 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  37.93 
 
 		 500 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  37.89 
 
 		 506 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  37.89 
 
 		 506 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  40 
 
 		 499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.62 
 
 		 500 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  36.81 
 
 		 504 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1844  hypothetical protein  40.13 
 
 		 485 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0173985  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  34.86 
 
 		 502 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  38.36 
 
 		 497 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  36.36 
 
 		 502 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  37.93 
 
 		 500 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  36.55 
 
 		 500 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  41.1 
 
 		 500 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.42 
 
 		 501 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33.33 
 
 		 519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  35.71 
 
 		 504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  39.6 
 
 		 504 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.42 
 
 		 501 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  36.99 
 
 		 504 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  36.99 
 
 		 504 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  36.99 
 
 		 504 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  38.55 
 
 		 504 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  41.18 
 
 		 505 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  37.01 
 
 		 500 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  38.16 
 
 		 500 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  37.58 
 
 		 505 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.76 
 
 		 503 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 502 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  35.86 
 
 		 500 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  36.05 
 
 		 501 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.12 
 
 		 504 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  36.3 
 
 		 504 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  36.3 
 
 		 504 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.2 
 
 		 497 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  34.36 
 
 		 504 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  34.66 
 
 		 506 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  39.16 
 
 		 503 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.61 
 
 		 505 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.61 
 
 		 505 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  35.17 
 
 		 499 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4195  hypothetical protein  42.6 
 
 		 503 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  37.84 
 
 		 497 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  39.47 
 
 		 505 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  35.62 
 
 		 504 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.85 
 
 		 504 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  37.08 
 
 		 508 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  39.73 
 
 		 501 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2397  hypothetical protein  41.1 
 
 		 499 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  34.57 
 
 		 531 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  41.96 
 
 		 505 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.07 
 
 		 502 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  33.85 
 
 		 529 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33.33 
 
 		 515 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  41.96 
 
 		 505 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.46 
 
 		 502 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.24 
 
 		 500 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  39.61 
 
 		 504 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  37.67 
 
 		 502 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  40 
 
 		 507 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  41.56 
 
 		 505 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  37.5 
 
 		 506 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  38.97 
 
 		 504 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  38.97 
 
 		 504 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  38.97 
 
 		 504 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  38.97 
 
 		 504 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  38.97 
 
 		 504 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  38.24 
 
 		 505 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>