238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6112 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  89.31 
 
 		 505 aa  855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  971    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  82.57 
 
 		 505 aa  781    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  89.7 
 
 		 505 aa  857    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3919  hypothetical protein  75.1 
 
 		 514 aa  689    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  82.77 
 
 		 505 aa  784    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  80.59 
 
 		 505 aa  763    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  67.72 
 
 		 499 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  84.55 
 
 		 505 aa  811    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  68.32 
 
 		 499 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  73.54 
 
 		 489 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  88.91 
 
 		 505 aa  854    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  69.31 
 
 		 499 aa  594  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  62.71 
 
 		 495 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  61.29 
 
 		 500 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  61.71 
 
 		 504 aa  545  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8068  hypothetical protein  65.04 
 
 		 499 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3006  hypothetical protein  61.44 
 
 		 513 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0383827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  57.31 
 
 		 504 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  58.13 
 
 		 504 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  58.59 
 
 		 495 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  61.3 
 
 		 512 aa  528  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3500  hypothetical protein  59.39 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583954  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  56.59 
 
 		 509 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  57.11 
 
 		 504 aa  524  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  57.75 
 
 		 501 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  57.59 
 
 		 504 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  56.39 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  56.3 
 
 		 504 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  58.65 
 
 		 507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.16 
 
 		 511 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3702  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.88 
 
 		 507 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37810  hypothetical protein  56.34 
 
 		 504 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0397  hypothetical protein  59.45 
 
 		 497 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3246  hypothetical protein  61.68 
 
 		 516 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442644  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1393  hypothetical protein  59.8 
 
 		 539 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0764737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3235  hypothetical protein  61.68 
 
 		 516 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3297  hypothetical protein  61.68 
 
 		 516 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0388463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0996  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.29 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3627  protein of unknown function DUF112 transmembrane  61.96 
 
 		 538 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.854154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3104  hypothetical protein  51.07 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.893861  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0594  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.5 
 
 		 512 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.006033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1827  protein of unknown function DUF112 transmembrane  53.2 
 
 		 518 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2146  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.69 
 
 		 517 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4161  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.01 
 
 		 503 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00860  hypothetical protein  49.16 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0201156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  46.5 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0068  protein of unknown function DUF112 transmembrane  60.98 
 
 		 518 aa  428  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  46.51 
 
 		 500 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  46.3 
 
 		 500 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.55 
 
 		 500 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  45.19 
 
 		 502 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  45.67 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.23 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0321  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.58 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  45.36 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.8 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  44.65 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  43.93 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  46.4 
 
 		 505 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.42 
 
 		 508 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  45.49 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  43.55 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  43.84 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  45.4 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  44.62 
 
 		 501 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  45.47 
 
 		 503 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.11 
 
 		 504 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.42 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  45.24 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  44.73 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.49 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  45.91 
 
 		 515 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.23 
 
 		 536 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  44.59 
 
 		 502 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  43.74 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.01 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  41.58 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.23 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.49 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  41.47 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  41.47 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  41.6 
 
 		 500 aa  382  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  45.36 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  41.21 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  41.47 
 
 		 504 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  41.47 
 
 		 504 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.87 
 
 		 503 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.94 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  41.68 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  40.83 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  46.34 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  46.32 
 
 		 501 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.74 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  42.62 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.73 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  45.51 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  46.12 
 
 		 504 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.71 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  43.86 
 
 		 502 aa  369  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>