238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0321 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4161  protein of unknown function DUF112 transmembrane  69.6 
 
 		 503 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0321  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 501 aa  950    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00860  hypothetical protein  64.47 
 
 		 501 aa  609  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0201156  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1827  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.51 
 
 		 518 aa  555  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2146  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.5 
 
 		 517 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0996  protein of unknown function DUF112 transmembrane  59.32 
 
 		 513 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37810  hypothetical protein  51.91 
 
 		 504 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8068  hypothetical protein  54.76 
 
 		 499 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  49.89 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  49.2 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  50.85 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  48.53 
 
 		 495 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.61 
 
 		 509 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  49.79 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  49.9 
 
 		 500 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  50.64 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.29 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  49.68 
 
 		 504 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  49.47 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.5 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  51.59 
 
 		 505 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  49.37 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  51.4 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  48.76 
 
 		 504 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  48.87 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  50.63 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  48.84 
 
 		 507 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  49.58 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  50.32 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  50.11 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.7 
 
 		 511 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  51.16 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.48 
 
 		 504 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  48.25 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3627  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.11 
 
 		 538 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.854154  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3006  hypothetical protein  48.23 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0383827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0397  hypothetical protein  49.47 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.32 
 
 		 499 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0594  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.35 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.006033 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3919  hypothetical protein  48.37 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1393  hypothetical protein  49.9 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0764737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3500  hypothetical protein  48.13 
 
 		 513 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583954  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3702  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3104  hypothetical protein  43.53 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.893861  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3235  hypothetical protein  49.16 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3297  hypothetical protein  49.16 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0388463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3246  hypothetical protein  49.16 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442644  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0068  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.31 
 
 		 518 aa  354  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  40.68 
 
 		 502 aa  345  8e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  39.71 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  39.84 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  38.45 
 
 		 500 aa  329  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.92 
 
 		 500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.65 
 
 		 503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  38.75 
 
 		 505 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  38.1 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  37.1 
 
 		 507 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  37.74 
 
 		 503 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  37.4 
 
 		 504 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  38.16 
 
 		 500 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.33 
 
 		 500 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  38.57 
 
 		 505 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  39.52 
 
 		 500 aa  323  6e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  39.18 
 
 		 504 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.12 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  40.04 
 
 		 502 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1455  hypothetical protein  37.6 
 
 		 506 aa  319  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  36.1 
 
 		 508 aa  319  7e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.18 
 
 		 504 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  38.96 
 
 		 500 aa  319  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  37.79 
 
 		 503 aa  319  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.89 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.38 
 
 		 502 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  37.55 
 
 		 503 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1416  tricarboxylate transport protein TctA, putative  38.6 
 
 		 504 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4395  hypothetical protein  38.21 
 
 		 504 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  40.93 
 
 		 499 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.13 
 
 		 503 aa  317  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  37.4 
 
 		 501 aa  317  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  38 
 
 		 502 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49480  tripartite tricarboxylate transporter large hypothetical protein  39.59 
 
 		 506 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4305  hypothetical protein  38.79 
 
 		 504 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  38.87 
 
 		 503 aa  316  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  38.61 
 
 		 500 aa  316  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  35.19 
 
 		 500 aa  315  8e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  35.92 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  35.92 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  35.92 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  35.92 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1056  hypothetical protein  38.01 
 
 		 504 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  35.92 
 
 		 506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.42 
 
 		 506 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.2 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  38.54 
 
 		 500 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  35.53 
 
 		 508 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3968  hypothetical protein  38.49 
 
 		 504 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.675721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  37.7 
 
 		 504 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  35.71 
 
 		 506 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1351  hypothetical protein  39.69 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0786425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  39.87 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>